We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZNF260
(GeneCards)
ModelZN260_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusYCYTTTdYATRGCTGYATASTATTCCA
Best auROC (human)0.937
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words277
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF146-like factors {2.3.3.55}
HGNCHGNC:13499
EntrezGeneGeneID:339324
(SSTAR profile)
UniProt IDZN260_HUMAN
UniProt ACQ3ZCT1
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -6.01454
0.0005 -3.00399
0.0001 3.55116
GTEx tissue expression atlas ZNF260 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF260 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
012.03.00.00.015.048.01.03.00.07.00.01.07.0161.05.023.0
021.01.02.020.014.073.01.0131.00.03.02.01.03.011.02.011.0
031.02.00.015.08.06.03.071.00.00.00.07.02.04.04.0153.0
041.03.00.07.01.01.00.010.00.00.02.05.02.07.07.0230.0
051.01.00.02.01.03.01.06.01.01.01.06.01.03.012.0236.0
061.02.01.00.02.00.03.03.03.02.00.09.089.019.039.0103.0
077.033.01.054.05.05.08.05.07.08.02.026.010.031.05.069.0
0824.02.01.02.058.08.04.07.015.00.00.01.0139.04.02.09.0
092.064.01.0169.00.03.00.011.00.00.00.07.00.07.01.011.0
100.00.01.01.035.06.016.017.00.01.00.01.017.02.0148.031.0
110.00.052.00.05.00.03.01.014.01.0143.07.02.02.045.01.0
120.04.00.017.00.02.00.01.00.0185.02.056.01.04.00.04.0
130.00.01.00.02.02.00.0191.00.01.00.01.01.03.00.074.0
140.02.01.00.02.01.00.03.00.00.01.00.02.018.0243.03.0
154.00.00.00.01.013.00.07.022.0169.01.053.02.02.00.02.0
1614.00.014.01.0162.03.019.00.00.01.00.00.043.02.016.01.0
171.00.03.0215.00.00.01.05.00.00.00.049.01.00.00.01.0
181.00.00.01.00.00.00.00.01.02.00.01.0236.04.07.023.0
1937.026.0170.05.01.04.01.00.02.04.01.00.05.015.02.03.0
200.00.03.042.02.05.06.036.00.01.00.0173.01.00.01.06.0
212.01.00.00.05.00.00.01.07.01.00.02.0246.00.05.06.0
220.029.03.0228.00.00.00.02.00.01.00.04.00.03.00.06.0
230.00.00.00.01.00.00.032.00.01.00.02.00.01.02.0237.0
240.01.00.00.00.01.00.01.00.01.00.01.00.0255.00.016.0
250.00.00.00.05.0240.02.011.00.00.00.00.00.013.01.04.0
260.03.00.02.0222.06.07.018.00.02.00.01.08.00.07.00.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-2.013-1.659-3.914-3.914-0.1371.011-2.567-1.659-3.914-0.873-3.914-2.567-0.8732.216-1.1910.283
02-2.567-2.567-2.0130.145-0.2041.427-2.5672.01-3.914-1.659-2.013-2.567-1.659-0.439-2.013-0.439
03-2.567-2.013-3.914-0.137-0.746-1.019-1.6591.4-3.914-3.914-3.914-0.873-2.013-1.398-1.3982.165
04-2.567-1.659-3.914-0.873-2.567-2.567-3.914-0.531-3.914-3.914-2.013-1.191-2.013-0.873-0.8732.572
05-2.567-2.567-3.914-2.013-2.567-1.659-2.567-1.019-2.567-2.567-2.567-1.019-2.567-1.659-0.3542.597
06-2.567-2.013-2.567-3.914-2.013-3.914-1.659-1.659-1.659-2.013-3.914-0.6321.6250.0950.8051.77
07-0.8730.639-2.5671.127-1.191-1.191-0.746-1.191-0.873-0.746-2.0130.404-0.5310.577-1.1911.371
080.325-2.013-2.567-2.0131.199-0.746-1.398-0.873-0.137-3.914-3.914-2.5672.069-1.398-2.013-0.632
09-2.0131.296-2.5672.264-3.914-1.659-3.914-0.439-3.914-3.914-3.914-0.873-3.914-0.873-2.567-0.439
10-3.914-3.914-2.567-2.5670.697-1.019-0.074-0.014-3.914-2.567-3.914-2.567-0.014-2.0132.1320.577
11-3.914-3.9141.09-3.914-1.191-3.914-1.659-2.567-0.204-2.5672.097-0.873-2.013-2.0130.946-2.567
12-3.914-1.398-3.914-0.014-3.914-2.013-3.914-2.567-3.9142.354-2.0131.164-2.567-1.398-3.914-1.398
13-3.914-3.914-2.567-3.914-2.013-2.013-3.9142.386-3.914-2.567-3.914-2.567-2.567-1.659-3.9141.441
14-3.914-2.013-2.567-3.914-2.013-2.567-3.914-1.659-3.914-3.914-2.567-3.914-2.0130.0422.627-1.659
15-1.398-3.914-3.914-3.914-2.567-0.276-3.914-0.8730.2392.264-2.5671.109-2.013-2.013-3.914-2.013
16-0.204-3.914-0.204-2.5672.222-1.6590.095-3.914-3.914-2.567-3.914-3.9140.901-2.013-0.074-2.567
17-2.567-3.914-1.6592.504-3.914-3.914-2.567-1.191-3.914-3.914-3.9141.031-2.567-3.914-3.914-2.567
18-2.567-3.914-3.914-2.567-3.914-3.914-3.914-3.914-2.567-2.013-3.914-2.5672.597-1.398-0.8730.283
190.7520.4042.27-1.191-2.567-1.398-2.567-3.914-2.013-1.398-2.567-3.914-1.191-0.137-2.013-1.659
20-3.914-3.914-1.6590.878-2.013-1.191-1.0190.725-3.914-2.567-3.9142.287-2.567-3.914-2.567-1.019
21-2.013-2.567-3.914-3.914-1.191-3.914-3.914-2.567-0.873-2.567-3.914-2.0132.639-3.914-1.191-1.019
22-3.9140.511-1.6592.563-3.914-3.914-3.914-2.013-3.914-2.567-3.914-1.398-3.914-1.659-3.914-1.019
23-3.914-3.914-3.914-3.914-2.567-3.914-3.9140.609-3.914-2.567-3.914-2.013-3.914-2.567-2.0132.602
24-3.914-2.567-3.914-3.914-3.914-2.567-3.914-2.567-3.914-2.567-3.914-2.567-3.9142.675-3.914-0.074
25-3.914-3.914-3.914-3.914-1.1912.614-2.013-0.439-3.914-3.914-3.914-3.914-3.914-0.276-2.567-1.398
26-3.914-1.659-3.914-2.0132.536-1.019-0.8730.042-3.914-2.013-3.914-2.567-0.746-3.914-0.873-3.914