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Model info
Transcription factorZNF260
(GeneCards)
ModelZN260_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusYCYTTTdYATRGCTGYATASTATTCCA
Best auROC (human)0.937
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words277
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF146-like factors {2.3.3.55}
HGNCHGNC:13499
EntrezGeneGeneID:339324
(SSTAR profile)
UniProt IDZN260_HUMAN
UniProt ACQ3ZCT1
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -6.01454
0.0005 -3.00399
0.0001 3.55116
GTEx tissue expression atlas ZNF260 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF260 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
012.03.00.00.015.048.01.03.00.07.00.01.07.0161.05.023.0
021.01.02.020.014.073.01.0131.00.03.02.01.03.011.02.011.0
031.02.00.015.08.06.03.071.00.00.00.07.02.04.04.0153.0
041.03.00.07.01.01.00.010.00.00.02.05.02.07.07.0230.0
051.01.00.02.01.03.01.06.01.01.01.06.01.03.012.0236.0
061.02.01.00.02.00.03.03.03.02.00.09.089.019.039.0103.0
077.033.01.054.05.05.08.05.07.08.02.026.010.031.05.069.0
0824.02.01.02.058.08.04.07.015.00.00.01.0139.04.02.09.0
092.064.01.0169.00.03.00.011.00.00.00.07.00.07.01.011.0
100.00.01.01.035.06.016.017.00.01.00.01.017.02.0148.031.0
110.00.052.00.05.00.03.01.014.01.0143.07.02.02.045.01.0
120.04.00.017.00.02.00.01.00.0185.02.056.01.04.00.04.0
130.00.01.00.02.02.00.0191.00.01.00.01.01.03.00.074.0
140.02.01.00.02.01.00.03.00.00.01.00.02.018.0243.03.0
154.00.00.00.01.013.00.07.022.0169.01.053.02.02.00.02.0
1614.00.014.01.0162.03.019.00.00.01.00.00.043.02.016.01.0
171.00.03.0215.00.00.01.05.00.00.00.049.01.00.00.01.0
181.00.00.01.00.00.00.00.01.02.00.01.0236.04.07.023.0
1937.026.0170.05.01.04.01.00.02.04.01.00.05.015.02.03.0
200.00.03.042.02.05.06.036.00.01.00.0173.01.00.01.06.0
212.01.00.00.05.00.00.01.07.01.00.02.0246.00.05.06.0
220.029.03.0228.00.00.00.02.00.01.00.04.00.03.00.06.0
230.00.00.00.01.00.00.032.00.01.00.02.00.01.02.0237.0
240.01.00.00.00.01.00.01.00.01.00.01.00.0255.00.016.0
250.00.00.00.05.0240.02.011.00.00.00.00.00.013.01.04.0
260.03.00.02.0222.06.07.018.00.02.00.01.08.00.07.00.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-2.013-1.659-3.914-3.914-0.1371.011-2.567-1.659-3.914-0.873-3.914-2.567-0.8732.216-1.1910.283
02-2.567-2.567-2.0130.145-0.2041.427-2.5672.01-3.914-1.659-2.013-2.567-1.659-0.439-2.013-0.439
03-2.567-2.013-3.914-0.137-0.746-1.019-1.6591.4-3.914-3.914-3.914-0.873-2.013-1.398-1.3982.165
04-2.567-1.659-3.914-0.873-2.567-2.567-3.914-0.531-3.914-3.914-2.013-1.191-2.013-0.873-0.8732.572
05-2.567-2.567-3.914-2.013-2.567-1.659-2.567-1.019-2.567-2.567-2.567-1.019-2.567-1.659-0.3542.597
06-2.567-2.013-2.567-3.914-2.013-3.914-1.659-1.659-1.659-2.013-3.914-0.6321.6250.0950.8051.77
07-0.8730.639-2.5671.127-1.191-1.191-0.746-1.191-0.873-0.746-2.0130.404-0.5310.577-1.1911.371
080.325-2.013-2.567-2.0131.199-0.746-1.398-0.873-0.137-3.914-3.914-2.5672.069-1.398-2.013-0.632
09-2.0131.296-2.5672.264-3.914-1.659-3.914-0.439-3.914-3.914-3.914-0.873-3.914-0.873-2.567-0.439
10-3.914-3.914-2.567-2.5670.697-1.019-0.074-0.014-3.914-2.567-3.914-2.567-0.014-2.0132.1320.577
11-3.914-3.9141.09-3.914-1.191-3.914-1.659-2.567-0.204-2.5672.097-0.873-2.013-2.0130.946-2.567
12-3.914-1.398-3.914-0.014-3.914-2.013-3.914-2.567-3.9142.354-2.0131.164-2.567-1.398-3.914-1.398
13-3.914-3.914-2.567-3.914-2.013-2.013-3.9142.386-3.914-2.567-3.914-2.567-2.567-1.659-3.9141.441
14-3.914-2.013-2.567-3.914-2.013-2.567-3.914-1.659-3.914-3.914-2.567-3.914-2.0130.0422.627-1.659
15-1.398-3.914-3.914-3.914-2.567-0.276-3.914-0.8730.2392.264-2.5671.109-2.013-2.013-3.914-2.013
16-0.204-3.914-0.204-2.5672.222-1.6590.095-3.914-3.914-2.567-3.914-3.9140.901-2.013-0.074-2.567
17-2.567-3.914-1.6592.504-3.914-3.914-2.567-1.191-3.914-3.914-3.9141.031-2.567-3.914-3.914-2.567
18-2.567-3.914-3.914-2.567-3.914-3.914-3.914-3.914-2.567-2.013-3.914-2.5672.597-1.398-0.8730.283
190.7520.4042.27-1.191-2.567-1.398-2.567-3.914-2.013-1.398-2.567-3.914-1.191-0.137-2.013-1.659
20-3.914-3.914-1.6590.878-2.013-1.191-1.0190.725-3.914-2.567-3.9142.287-2.567-3.914-2.567-1.019
21-2.013-2.567-3.914-3.914-1.191-3.914-3.914-2.567-0.873-2.567-3.914-2.0132.639-3.914-1.191-1.019
22-3.9140.511-1.6592.563-3.914-3.914-3.914-2.013-3.914-2.567-3.914-1.398-3.914-1.659-3.914-1.019
23-3.914-3.914-3.914-3.914-2.567-3.914-3.9140.609-3.914-2.567-3.914-2.013-3.914-2.567-2.0132.602
24-3.914-2.567-3.914-3.914-3.914-2.567-3.914-2.567-3.914-2.567-3.914-2.567-3.9142.675-3.914-0.074
25-3.914-3.914-3.914-3.914-1.1912.614-2.013-0.439-3.914-3.914-3.914-3.914-3.914-0.276-2.567-1.398
26-3.914-1.659-3.914-2.0132.536-1.019-0.8730.042-3.914-2.013-3.914-2.567-0.746-3.914-0.873-3.914