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Model info
Transcription factorZNF274
(GeneCards)
ModelZN274_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusCATMAGAGAAYTCATACWGGWGA
Best auROC (human)0.955
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)26
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words129
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyunclassified {2.3.3.0}
HGNCHGNC:13068
EntrezGeneGeneID:10782
(SSTAR profile)
UniProt IDZN274_HUMAN
UniProt ACQ96GC6
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -10.34909
0.0005 -7.32039
0.0001 -0.63659
GTEx tissue expression atlas ZNF274 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF274 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
011.00.00.00.0109.01.00.01.00.00.00.00.00.00.00.01.0
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PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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13-3.215-3.215-3.215-3.2152.734-3.215-3.215-3.215-3.215-3.215-3.215-3.215-3.215-3.215-3.215-3.215
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