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Model info
Transcription factorZNF317
(GeneCards)
ModelZN317_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusdWWRRhWRACWRCWGAYTYYYYR
Best auROC (human)0.906
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words434
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyunclassified {2.3.3.0}
HGNCHGNC:13507
EntrezGeneGeneID:57693
(SSTAR profile)
UniProt IDZN317_HUMAN
UniProt ACQ96PQ6
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 6.695010000000001
0.0005 8.87851
0.0001 13.58816
GTEx tissue expression atlas ZNF317 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF317 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0137.010.017.015.026.04.05.011.027.01.010.013.0167.013.029.048.0
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0323.09.0243.09.037.04.04.02.013.03.030.02.06.03.042.03.0
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142.01.0162.05.010.00.013.01.04.01.012.02.024.01.0192.03.0
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199.014.03.010.07.021.00.012.06.07.03.08.023.0213.015.082.0
204.05.07.029.013.023.09.0210.04.01.05.011.06.018.015.073.0
213.05.011.08.015.018.01.013.08.011.012.05.016.0223.021.063.0
2216.05.09.012.0216.021.04.016.024.04.010.07.035.012.029.013.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.309-0.972-0.457-0.579-0.039-1.835-1.629-0.88-0.002-2.99-0.972-0.7181.808-0.7180.0680.567
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