We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZNF329
(GeneCards)
ModelZN329_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusSCTKGATCMARCYdYdCCTGAAR
Best auROC (human)0.857
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words305
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyunclassified {2.3.3.0}
HGNCHGNC:14209
EntrezGeneGeneID:79673
(SSTAR profile)
UniProt IDZN329_HUMAN
UniProt ACQ86UD4
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -5.82859
0.0005 -2.81114
0.0001 3.7903599999999997
GTEx tissue expression atlas ZNF329 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF329 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
012.09.01.00.01.0234.00.01.01.037.00.01.00.015.00.00.0
020.01.00.03.02.030.00.0263.00.00.01.00.01.00.00.01.0
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040.00.025.00.00.00.03.00.04.01.0223.01.00.00.045.00.0
054.00.00.00.00.00.00.01.0287.02.04.03.01.00.00.00.0
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070.04.00.02.00.03.00.00.01.019.01.00.07.0250.07.08.0
080.07.00.01.095.0157.09.015.00.07.00.01.00.09.01.00.0
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111.050.00.01.00.014.00.01.03.0222.00.04.00.06.00.00.0
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133.02.07.03.0116.016.018.024.01.00.02.00.032.04.067.07.0
144.020.016.0112.03.02.01.016.011.012.08.063.01.09.02.022.0
159.01.07.02.026.00.07.010.015.02.08.02.068.07.0108.030.0
161.0113.01.03.00.09.00.01.02.0127.00.01.00.043.00.01.0
171.02.00.00.01.0289.00.02.00.00.00.01.01.04.01.00.0
180.00.01.02.01.00.01.0293.00.00.01.00.00.00.00.03.0
190.00.01.00.00.00.00.00.01.00.02.00.02.00.0296.00.0
203.00.00.00.00.00.00.00.0271.024.02.02.00.00.00.00.0
21249.01.08.016.019.01.02.02.02.00.00.00.01.01.00.00.0
2242.020.0194.015.00.00.00.03.00.01.08.01.01.03.013.01.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-2.099-0.72-2.651-3.987-2.6512.5-3.987-2.651-2.6510.664-3.987-2.651-3.987-0.225-3.987-3.987
02-3.987-2.651-3.987-1.746-2.0990.456-3.9872.617-3.987-3.987-2.651-3.987-2.651-3.987-3.987-2.651
03-3.987-3.987-2.099-2.651-1.107-2.099-1.107-0.103-3.987-3.987-2.651-3.9870.006-2.6512.4390.352
04-3.987-3.9870.276-3.987-3.987-3.987-1.746-3.987-1.485-2.6512.452-2.651-3.987-3.9870.858-3.987
05-1.485-3.987-3.987-3.987-3.987-3.987-3.987-2.6512.704-2.099-1.485-1.746-2.651-3.987-3.987-3.987
06-1.107-1.746-0.1622.632-3.987-3.987-2.651-2.651-3.987-3.987-2.099-2.099-3.987-3.987-2.099-2.099
07-3.987-1.485-3.987-2.099-3.987-1.746-3.987-3.987-2.6510.006-2.651-3.987-0.9612.566-0.961-0.833
08-3.987-0.961-3.987-2.6511.6012.102-0.72-0.225-3.987-0.961-3.987-2.651-3.987-0.72-2.651-3.987
091.268-0.527-0.619-1.1072.175-1.278-2.651-1.278-1.107-2.651-1.746-3.987-0.527-3.987-1.278-2.651
100.637-1.1072.378-1.278-0.619-2.099-1.278-3.987-1.746-1.278-0.527-3.987-1.746-2.099-1.107-2.651
11-2.6510.963-3.987-2.651-3.987-0.292-3.987-2.651-1.7462.448-3.987-1.485-3.987-1.107-3.987-3.987
12-2.099-2.651-2.651-3.987-0.4422.199-2.0991.701-3.987-3.987-3.987-3.987-2.651-3.987-3.987-1.278
13-1.746-2.099-0.961-1.7461.8-0.162-0.0470.236-2.651-3.987-2.099-3.9870.52-1.4851.253-0.961
14-1.4850.057-0.1621.765-1.746-2.099-2.651-0.162-0.527-0.442-0.8331.192-2.651-0.72-2.0990.151
15-0.72-2.651-0.961-2.0990.315-3.987-0.961-0.619-0.225-2.099-0.833-2.0991.268-0.9611.7290.456
16-2.6511.774-2.651-1.746-3.987-0.72-3.987-2.651-2.0991.89-3.987-2.651-3.9870.813-3.987-2.651
17-2.651-2.099-3.987-3.987-2.6512.711-3.987-2.099-3.987-3.987-3.987-2.651-2.651-1.485-2.651-3.987
18-3.987-3.987-2.651-2.099-2.651-3.987-2.6512.725-3.987-3.987-2.651-3.987-3.987-3.987-3.987-1.746
19-3.987-3.987-2.651-3.987-3.987-3.987-3.987-3.987-2.651-3.987-2.099-3.987-2.099-3.9872.735-3.987
20-1.746-3.987-3.987-3.987-3.987-3.987-3.987-3.9872.6470.236-2.099-2.099-3.987-3.987-3.987-3.987
212.562-2.651-0.833-0.1620.006-2.651-2.099-2.099-2.099-3.987-3.987-3.987-2.651-2.651-3.987-3.987
220.790.0572.313-0.225-3.987-3.987-3.987-1.746-3.987-2.651-0.833-2.651-2.651-1.746-0.365-2.651