We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZNF335
(GeneCards)
ModelZN335_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length25
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusbRSbYKbYYnnvvhdvYGCCTGWhn
Best auROC (human)0.928
Best auROC (mouse)0.976
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)4
Aligned words118
TF familyFactors with multiple dispersed zinc fingers {2.3.4}
TF subfamilyunclassified {2.3.4.0}
HGNCHGNC:15807
EntrezGeneGeneID:63925
(SSTAR profile)
UniProt IDZN335_HUMAN
UniProt ACQ9H4Z2
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 4.55151
0.0005 6.62566
0.0001 11.09661
GTEx tissue expression atlas ZNF335 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF335 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
014.00.011.00.03.01.017.02.08.02.042.01.017.02.03.03.0
022.02.020.08.03.00.01.01.04.09.059.01.01.02.01.02.0
032.04.04.00.03.02.00.08.05.046.018.012.02.02.04.04.0
041.02.01.08.00.05.01.048.00.011.08.07.04.05.010.05.0
051.00.03.01.00.00.014.09.00.07.05.08.02.02.057.07.0
060.01.00.02.01.03.04.01.04.029.06.040.03.08.013.01.0
073.04.00.01.00.037.01.03.02.014.03.04.02.036.04.02.0
080.02.00.05.00.055.06.030.00.03.01.04.00.07.01.02.0
090.00.00.00.013.015.016.023.02.02.01.03.010.09.06.016.0
107.06.07.05.09.06.06.05.00.013.04.06.011.07.016.08.0
116.012.07.02.011.03.012.06.013.05.09.06.09.01.012.02.0
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136.06.08.04.08.05.03.04.014.030.04.012.05.04.02.01.0
144.00.015.014.021.01.021.02.07.02.01.07.05.04.08.04.0
1511.09.08.09.00.03.03.01.011.026.08.00.013.06.04.04.0
161.09.00.025.05.012.00.027.04.08.01.010.00.01.01.012.0
172.00.08.00.01.00.029.00.00.00.02.00.03.01.070.00.0
181.04.00.01.01.00.00.00.00.0105.00.04.00.00.00.00.0
190.02.00.00.05.0104.00.00.00.00.00.00.03.02.00.00.0
202.00.00.06.01.07.02.098.00.00.00.00.00.00.00.00.0
211.00.02.00.00.00.05.02.00.00.01.01.03.03.092.06.0
223.01.00.00.01.00.01.01.060.011.01.028.03.02.00.04.0
2320.028.08.011.03.02.01.08.01.01.00.00.014.013.01.05.0
2410.010.09.09.05.011.04.024.00.07.01.02.01.012.02.09.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.563-3.2350.403-3.235-0.828-1.7610.829-1.190.095-1.191.724-1.7610.829-1.19-0.828-0.828
02-1.19-1.190.9890.095-0.828-3.235-1.761-1.761-0.5630.2092.061-1.761-1.761-1.19-1.761-1.19
03-1.19-0.563-0.563-3.235-0.828-1.19-3.2350.095-0.3541.8140.8860.488-1.19-1.19-0.563-0.563
04-1.761-1.19-1.7610.095-3.235-0.354-1.7611.856-3.2350.4030.095-0.034-0.563-0.3540.311-0.354
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07-0.828-0.563-3.235-1.761-3.2351.598-1.761-0.828-1.190.639-0.828-0.563-1.191.571-0.563-1.19
08-3.235-1.19-3.235-0.354-3.2351.992-0.1811.39-3.235-0.828-1.761-0.563-3.235-0.034-1.761-1.19
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12-0.828-0.3541.21-0.181-0.181-0.5630.311-1.7610.488-0.1810.939-0.828-0.828-0.354-0.181-1.19
13-0.181-0.1810.095-0.5630.095-0.354-0.828-0.5630.6391.39-0.5630.488-0.354-0.563-1.19-1.761
14-0.563-3.2350.7060.6391.037-1.7611.037-1.19-0.034-1.19-1.761-0.034-0.354-0.5630.095-0.563
150.4030.2090.0950.209-3.235-0.828-0.828-1.7610.4031.2480.095-3.2350.566-0.181-0.563-0.563
16-1.7610.209-3.2351.21-0.3540.488-3.2351.286-0.5630.095-1.7610.311-3.235-1.761-1.7610.488
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18-1.761-0.563-3.235-1.761-1.761-3.235-3.235-3.235-3.2352.636-3.235-0.563-3.235-3.235-3.235-3.235
19-3.235-1.19-3.235-3.235-0.3542.626-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-0.828-1.19-3.235-3.235
20-1.19-3.235-3.235-0.181-1.761-0.034-1.192.567-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235
21-1.761-3.235-1.19-3.235-3.235-3.235-0.354-1.19-3.235-3.235-1.761-1.761-0.828-0.8282.504-0.181
22-0.828-1.761-3.235-3.235-1.761-3.235-1.761-1.7612.0780.403-1.7611.322-0.828-1.19-3.235-0.563
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240.3110.3110.2090.209-0.3540.403-0.5631.169-3.235-0.034-1.761-1.19-1.7610.488-1.190.209