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Model info
Transcription factorZNF335
(GeneCards)
ModelZN335_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length25
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusbRSbYKbYYnnvvhdvYGCCTGWhn
Best auROC (human)0.928
Best auROC (mouse)0.976
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)4
Aligned words118
TF familyFactors with multiple dispersed zinc fingers {2.3.4}
TF subfamilyunclassified {2.3.4.0}
HGNCHGNC:15807
EntrezGeneGeneID:63925
(SSTAR profile)
UniProt IDZN335_HUMAN
UniProt ACQ9H4Z2
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 4.55151
0.0005 6.62566
0.0001 11.09661
GTEx tissue expression atlas ZNF335 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF335 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
014.00.011.00.03.01.017.02.08.02.042.01.017.02.03.03.0
022.02.020.08.03.00.01.01.04.09.059.01.01.02.01.02.0
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041.02.01.08.00.05.01.048.00.011.08.07.04.05.010.05.0
051.00.03.01.00.00.014.09.00.07.05.08.02.02.057.07.0
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116.012.07.02.011.03.012.06.013.05.09.06.09.01.012.02.0
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1511.09.08.09.00.03.03.01.011.026.08.00.013.06.04.04.0
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172.00.08.00.01.00.029.00.00.00.02.00.03.01.070.00.0
181.04.00.01.01.00.00.00.00.0105.00.04.00.00.00.00.0
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202.00.00.06.01.07.02.098.00.00.00.00.00.00.00.00.0
211.00.02.00.00.00.05.02.00.00.01.01.03.03.092.06.0
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2320.028.08.011.03.02.01.08.01.01.00.00.014.013.01.05.0
2410.010.09.09.05.011.04.024.00.07.01.02.01.012.02.09.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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12-0.828-0.3541.21-0.181-0.181-0.5630.311-1.7610.488-0.1810.939-0.828-0.828-0.354-0.181-1.19
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240.3110.3110.2090.209-0.3540.403-0.5631.169-3.235-0.034-1.761-1.19-1.7610.488-1.190.209