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Model info
Transcription factorZnf335
ModelZN335_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length25
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusndRGvYKbCYnvnRvdvYGCCTGWn
Best auROC (human)0.894
Best auROC (mouse)0.987
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)4
Aligned words114
TF familyFactors with multiple dispersed zinc fingers {2.3.4}
TF subfamilyunclassified {2.3.4.0}
MGIMGI:2682313
EntrezGeneGeneID:329559
(SSTAR profile)
UniProt IDZN335_MOUSE
UniProt ACA2A5K6
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 4.14866
0.0005 6.26521
0.0001 10.86086
GTEx tissue expression atlas Znf335 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
016.03.08.05.01.02.011.07.04.06.023.08.04.01.017.08.0
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032.01.021.01.01.01.05.00.07.04.057.02.03.00.09.00.0
041.02.010.00.01.01.01.03.017.036.030.09.00.02.01.00.0
051.08.05.05.01.04.01.035.00.019.07.016.01.00.08.03.0
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119.07.013.02.015.02.012.04.04.013.02.05.06.04.013.03.0
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211.00.01.00.01.02.07.0100.00.00.00.00.00.00.00.02.0
220.00.02.00.00.00.02.00.01.00.06.01.02.02.091.07.0
233.00.00.00.01.00.01.00.061.012.05.023.05.01.00.02.0
2418.020.013.019.03.02.01.07.00.06.00.00.08.09.04.04.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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07-3.222-3.222-1.173-1.745-3.222-0.547-0.337-3.222-0.3370.7870.1111.809-3.222-0.8121.1-0.812
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20-3.222-1.173-3.222-1.745-1.7452.652-3.222-3.222-1.745-1.173-3.222-3.222-3.222-1.745-3.222-1.745
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22-3.222-3.222-1.173-3.222-3.222-3.222-1.173-3.222-1.745-3.222-0.164-1.745-1.173-1.1732.51-0.017
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240.9021.0060.5830.956-0.812-1.173-1.745-0.017-3.222-0.164-3.222-3.2220.1110.225-0.547-0.547