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Model info
Transcription factorZNF418
(GeneCards)
ModelZN418_HUMAN.H11DI.0.D
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length25
Quality
D
Motif rank
0
ConsensusWSGMWKGGAMKYGWAKSSAMTvdhM
Best auROC (human)0.732
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words256
TF familyFactors with multiple dispersed zinc fingers {2.3.4}
TF subfamilyZNF417-like factors {2.3.4.1}
HGNCHGNC:20647
EntrezGeneGeneID:147686
(SSTAR profile)
UniProt IDZN418_HUMAN
UniProt ACQ8TF45
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -5.39049
0.0005 -2.57794
0.0001 3.50666
GTEx tissue expression atlas ZNF418 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF418 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
012.010.081.01.01.01.02.01.01.00.04.00.01.078.032.011.0
020.00.05.00.011.00.070.08.06.01.0106.06.00.00.09.04.0
039.06.00.02.00.01.00.00.0100.079.03.08.01.014.03.00.0
04107.00.01.02.05.00.02.093.01.00.00.05.00.00.02.08.0
051.00.02.0110.00.00.00.00.01.00.02.02.03.01.0102.02.0
060.00.05.00.00.00.01.00.07.00.087.012.00.00.0110.04.0
071.00.06.00.00.00.00.00.03.00.0194.06.00.00.07.09.0
084.00.00.00.00.00.00.00.0205.01.01.00.00.00.015.00.0
09164.028.013.04.01.00.00.00.00.015.00.01.00.00.00.00.0
1017.00.075.073.00.00.00.043.01.00.00.012.00.00.00.05.0
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14120.00.01.00.06.00.00.00.03.00.01.00.091.00.04.00.0
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160.03.00.00.00.00.00.00.03.0100.01.03.02.00.0114.00.0
170.03.02.00.00.098.00.05.00.010.0104.01.00.02.00.01.0
180.00.00.00.019.00.00.094.0104.00.00.02.01.00.00.06.0
19110.013.01.00.00.00.00.00.00.00.00.00.02.097.00.03.0
204.00.00.0108.07.042.00.061.00.00.00.01.00.02.01.00.0
210.06.05.00.026.02.04.012.00.00.01.00.00.0102.063.05.0
220.00.025.01.0103.01.05.01.03.01.067.02.03.01.012.01.0
2314.05.03.087.00.02.01.00.016.057.06.030.01.03.00.01.0
2415.014.00.02.028.038.00.01.01.02.02.05.05.0102.02.09.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-1.822-0.3361.727-2.38-2.38-2.38-1.822-2.38-2.38-3.754-1.204-3.754-2.381.6890.805-0.243
02-3.754-3.754-0.997-3.754-0.243-3.7541.582-0.551-0.825-2.381.995-0.825-3.754-3.754-0.437-1.204
03-0.437-0.825-3.754-1.822-3.754-2.38-3.754-3.7541.9371.702-1.466-0.551-2.38-0.009-1.466-3.754
042.004-3.754-2.38-1.822-0.997-3.754-1.8221.865-2.38-3.754-3.754-0.997-3.754-3.754-1.822-0.551
05-2.38-3.754-1.8222.032-3.754-3.754-3.754-3.754-2.38-3.754-1.822-1.822-1.466-2.381.957-1.822
06-3.754-3.754-0.997-3.754-3.754-3.754-2.38-3.754-0.678-3.7541.798-0.159-3.754-3.7542.032-1.204
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08-1.204-3.754-3.754-3.754-3.754-3.754-3.754-3.7542.653-2.38-2.38-3.754-3.754-3.7540.059-3.754
092.430.673-0.081-1.204-2.38-3.754-3.754-3.754-3.7540.059-3.754-2.38-3.754-3.754-3.754-3.754
100.181-3.7541.651.623-3.754-3.754-3.7541.097-2.38-3.754-3.754-0.159-3.754-3.754-3.754-0.997
11-2.38-0.825-3.754-0.243-3.754-3.754-3.754-3.754-2.380.835-3.7541.05-3.7541.7270.1810.893
12-3.754-3.754-1.822-3.7540.389-2.381.907-2.38-3.754-3.7540.181-3.754-1.204-2.381.582-0.159
13-1.822-0.825-2.380.122-3.754-3.754-3.754-1.8222.076-3.754-1.8221.567-1.204-3.754-2.38-0.551
142.119-3.754-2.38-3.754-0.825-3.754-3.754-3.754-1.466-3.754-2.38-3.7541.843-3.754-1.204-3.754
15-1.466-3.7541.9662.068-3.754-3.754-3.754-3.754-3.754-3.754-1.204-1.822-3.754-3.754-3.754-3.754
16-3.754-1.466-3.754-3.754-3.754-3.754-3.754-3.754-1.4661.937-2.38-1.466-1.822-3.7542.068-3.754
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21-3.754-0.825-0.997-3.7540.599-1.822-1.204-0.159-3.754-3.754-2.38-3.754-3.7541.9571.477-0.997
22-3.754-3.7540.561-2.381.966-2.38-0.997-2.38-1.466-2.381.538-1.822-1.466-2.38-0.159-2.38
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