We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZNF436
(GeneCards)
ModelZN436_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusRKCMdGGARGRCTTCCTGGAGGAGGhG
Best auROC (human)0.984
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words485
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF180-like factors {2.3.3.58}
HGNCHGNC:20814
EntrezGeneGeneID:80818
(SSTAR profile)
UniProt IDZN436_HUMAN
UniProt ACQ9C0F3
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -12.96254
0.0005 -9.53949
0.0001 -2.08659
GTEx tissue expression atlas ZNF436 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF436 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0116.025.035.0215.02.03.00.07.07.06.020.0120.02.04.02.021.0
022.09.01.015.00.033.00.05.05.033.05.014.03.0339.012.09.0
033.04.01.02.0242.0113.03.056.09.08.01.00.04.030.08.01.0
0457.014.0169.018.075.028.011.041.03.01.05.04.011.04.040.04.0
057.01.0138.00.013.05.020.09.020.01.0202.02.02.02.062.01.0
062.00.040.00.01.01.07.00.09.00.0411.02.00.00.012.00.0
0710.00.01.01.00.00.00.01.0400.024.031.015.02.00.00.00.0
08206.01.0202.03.016.04.03.01.024.01.04.03.03.00.014.00.0
096.02.0239.02.02.00.04.00.011.01.0211.00.00.00.07.00.0
101.02.016.00.01.00.02.00.079.026.0348.08.00.01.01.00.0
110.081.00.00.00.029.00.00.00.0367.00.00.00.08.00.00.0
120.00.00.00.010.012.05.0458.00.00.00.00.00.00.00.00.0
131.00.07.02.01.00.00.011.00.01.03.01.03.026.032.0397.0
140.05.00.00.00.027.00.00.00.040.01.01.00.0403.01.07.0
150.00.00.00.034.0401.05.035.01.01.00.00.01.06.00.01.0
160.06.04.026.014.033.02.0359.00.02.00.03.02.09.03.022.0
171.00.015.00.018.00.021.011.01.00.07.01.05.00.0404.01.0
181.00.024.00.00.00.00.00.015.07.0414.011.00.00.012.01.0
1913.00.01.02.07.00.00.00.0430.02.07.011.012.00.00.00.0
2054.00.0408.00.01.00.01.00.02.00.06.00.00.00.013.00.0
211.00.055.01.00.00.00.00.04.01.0423.00.00.00.00.00.0
225.00.00.00.00.00.00.01.0435.017.06.020.01.00.00.00.0
2369.00.0372.00.06.00.011.00.01.00.05.00.00.00.021.00.0
242.00.074.00.00.00.00.00.011.01.0391.06.00.00.00.00.0
250.01.07.05.00.00.00.01.078.0104.022.0261.02.01.01.02.0
2611.04.065.00.061.08.035.02.06.02.022.00.011.04.0251.03.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.628-0.190.1421.948-2.554-2.204-4.375-1.425-1.425-1.57-0.4091.366-2.554-1.946-2.554-0.361
02-2.554-1.185-3.097-0.691-4.3750.084-4.375-1.74-1.740.084-1.74-0.758-2.2042.403-0.908-1.185
03-2.204-1.946-3.097-2.5542.0661.307-2.2040.608-1.185-1.298-3.097-4.375-1.946-0.01-1.298-3.097
040.626-0.7581.708-0.5130.898-0.078-0.9920.299-2.204-3.097-1.74-1.946-0.992-1.9460.274-1.946
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06-2.554-4.3750.274-4.375-3.097-3.097-1.425-4.375-1.185-4.3752.595-2.554-4.375-4.375-0.908-4.375
07-1.084-4.375-3.097-3.097-4.375-4.375-4.375-3.0972.568-0.230.022-0.691-2.554-4.375-4.375-4.375
081.906-3.0971.886-2.204-0.628-1.946-2.204-3.097-0.23-3.097-1.946-2.204-2.204-4.375-0.758-4.375
09-1.57-2.5542.054-2.554-2.554-4.375-1.946-4.375-0.992-3.0971.929-4.375-4.375-4.375-1.425-4.375
10-3.097-2.554-0.628-4.375-3.097-4.375-2.554-4.3750.95-0.1512.429-1.298-4.375-3.097-3.097-4.375
11-4.3750.975-4.375-4.375-4.375-0.044-4.375-4.375-4.3752.482-4.375-4.375-4.375-1.298-4.375-4.375
12-4.375-4.375-4.375-4.375-1.084-0.908-1.742.703-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375
13-3.097-4.375-1.425-2.554-3.097-4.375-4.375-0.992-4.375-3.097-2.204-3.097-2.204-0.1510.0542.561
14-4.375-1.74-4.375-4.375-4.375-0.114-4.375-4.375-4.3750.274-3.097-3.097-4.3752.576-3.097-1.425
15-4.375-4.375-4.375-4.3750.1132.571-1.740.142-3.097-3.097-4.375-4.375-3.097-1.57-4.375-3.097
16-4.375-1.57-1.946-0.151-0.7580.084-2.5542.46-4.375-2.554-4.375-2.204-2.554-1.185-2.204-0.316
17-3.097-4.375-0.691-4.375-0.513-4.375-0.361-0.992-3.097-4.375-1.425-3.097-1.74-4.3752.578-3.097
18-3.097-4.375-0.23-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375-0.691-1.4252.603-0.992-4.375-4.375-0.908-3.097
19-0.83-4.375-3.097-2.554-1.425-4.375-4.375-4.3752.64-2.554-1.425-0.992-0.908-4.375-4.375-4.375
200.572-4.3752.588-4.375-3.097-4.375-3.097-4.375-2.554-4.375-1.57-4.375-4.375-4.375-0.83-4.375
21-3.097-4.3750.59-3.097-4.375-4.375-4.375-4.375-1.946-3.0972.624-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375
22-1.74-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375-3.0972.652-0.569-1.57-0.409-3.097-4.375-4.375-4.375
230.815-4.3752.496-4.375-1.57-4.375-0.992-4.375-3.097-4.375-1.74-4.375-4.375-4.375-0.361-4.375
24-2.554-4.3750.885-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375-0.992-3.0972.545-1.57-4.375-4.375-4.375-4.375
25-4.375-3.097-1.425-1.74-4.375-4.375-4.375-3.0970.9371.224-0.3162.142-2.554-3.097-3.097-2.554
26-0.992-1.9460.756-4.3750.693-1.2980.142-2.554-1.57-2.554-0.316-4.375-0.992-1.9462.103-2.204