We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZNF490
(GeneCards)
ModelZN490_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusGTYTCTTGWAGRCAGCAKAYMRWTGGR
Best auROC (human)0.996
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words421
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF763-like factors {2.3.3.33}
HGNCHGNC:23705
EntrezGeneGeneID:57474
(SSTAR profile)
UniProt IDZN490_HUMAN
UniProt ACQ9ULM2
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -17.986089999999997
0.0005 -14.312539999999998
0.0001 -6.25784
GTEx tissue expression atlas ZNF490 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF490 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.01.01.020.00.00.00.03.01.04.06.0380.00.00.02.02.0
020.00.00.01.00.03.00.02.00.06.00.03.06.0254.02.0143.0
030.00.00.06.00.01.00.0262.00.00.00.02.00.01.00.0148.0
040.00.00.00.00.02.00.00.00.00.00.00.02.0413.03.00.0
050.00.00.02.04.014.00.0397.00.00.00.03.00.00.00.00.0
060.00.01.03.00.00.00.014.00.00.00.00.02.01.06.0393.0
070.00.02.00.00.00.01.00.00.00.07.00.02.02.0405.01.0
081.00.00.01.00.00.00.02.0211.07.06.0191.00.00.00.01.0
09204.01.04.03.07.00.00.00.06.00.00.00.0192.01.00.02.0
1041.04.0348.016.00.00.01.01.00.00.03.01.01.00.04.00.0
1115.00.027.00.04.00.00.00.0181.00.0171.04.015.00.03.00.0
120.0215.00.00.00.00.00.00.00.0201.00.00.00.04.00.00.0
130.00.00.00.0419.00.01.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
1494.00.0325.00.00.00.00.00.01.00.00.00.00.00.00.00.0
150.095.00.00.00.00.00.00.02.0322.01.00.00.00.00.00.0
162.00.00.00.0417.00.00.00.01.00.00.00.00.00.00.00.0
1721.031.0117.0251.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
1820.00.01.00.028.00.03.00.0113.01.03.00.0247.00.04.00.0
1915.0190.01.0202.00.00.00.01.00.03.00.08.00.00.00.00.0
204.09.01.01.065.0104.04.020.01.00.00.00.0100.0102.03.06.0
2127.024.0105.014.0203.02.06.04.01.01.04.02.010.01.013.03.0
2263.027.017.0134.00.00.01.027.021.03.05.099.05.01.00.017.0
232.02.02.083.00.01.00.030.00.01.01.021.03.05.06.0263.0
241.00.04.00.02.00.07.00.01.00.07.01.028.01.0361.07.0
254.00.028.00.01.00.00.00.046.02.0326.05.00.01.07.00.0
268.01.041.01.01.00.00.02.043.02.0273.043.00.00.05.00.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-4.256-2.962-2.962-0.268-4.256-4.256-4.256-2.065-2.962-1.805-1.4292.659-4.256-4.256-2.416-2.416
02-4.256-4.256-4.256-2.962-4.256-2.065-4.256-2.416-4.256-1.429-4.256-2.065-1.4292.257-2.4161.684
03-4.256-4.256-4.256-1.429-4.256-2.962-4.2562.288-4.256-4.256-4.256-2.416-4.256-2.962-4.2561.718
04-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-2.416-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-2.4162.742-2.065-4.256
05-4.256-4.256-4.256-2.416-1.805-0.616-4.2562.703-4.256-4.256-4.256-2.065-4.256-4.256-4.256-4.256
06-4.256-4.256-2.962-2.065-4.256-4.256-4.256-0.616-4.256-4.256-4.256-4.256-2.416-2.962-1.4292.693
07-4.256-4.256-2.416-4.256-4.256-4.256-2.962-4.256-4.256-4.256-1.284-4.256-2.416-2.4162.723-2.962
08-2.962-4.256-4.256-2.962-4.256-4.256-4.256-2.4162.072-1.284-1.4291.972-4.256-4.256-4.256-2.962
092.038-2.962-1.805-2.065-1.284-4.256-4.256-4.256-1.429-4.256-4.256-4.2561.978-2.962-4.256-2.416
100.441-1.8052.571-0.486-4.256-4.256-2.962-2.962-4.256-4.256-2.065-2.962-2.962-4.256-1.805-4.256
11-0.549-4.2560.028-4.256-1.805-4.256-4.256-4.2561.919-4.2561.862-1.805-0.549-4.256-2.065-4.256
12-4.2562.09-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.2562.023-4.256-4.256-4.256-1.805-4.256-4.256
13-4.256-4.256-4.256-4.2562.757-4.256-2.962-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256
141.265-4.2562.503-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-2.962-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256
15-4.2561.276-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-2.4162.494-2.962-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256
16-2.416-4.256-4.256-4.2562.752-4.256-4.256-4.256-2.962-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256
17-0.220.1641.4832.245-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256
18-0.268-4.256-2.962-4.2560.064-4.256-2.065-4.2561.449-2.962-2.065-4.2562.229-4.256-1.805-4.256
19-0.5491.967-2.9622.028-4.256-4.256-4.256-2.962-4.256-2.065-4.256-1.156-4.256-4.256-4.256-4.256
20-1.805-1.044-2.962-2.9620.8981.366-1.805-0.268-2.962-4.256-4.256-4.2561.3271.347-2.065-1.429
210.028-0.0881.376-0.6162.033-2.416-1.429-1.805-2.962-2.962-1.805-2.416-0.942-2.962-0.688-2.065
220.8670.028-0.4271.619-4.256-4.256-2.9620.028-0.22-2.065-1.61.317-1.6-2.962-4.256-0.427
23-2.416-2.416-2.4161.141-4.256-2.962-4.2560.132-4.256-2.962-2.962-0.22-2.065-1.6-1.4292.292
24-2.962-4.256-1.805-4.256-2.416-4.256-1.284-4.256-2.962-4.256-1.284-2.9620.064-2.9622.608-1.284
25-1.805-4.2560.064-4.256-2.962-4.256-4.256-4.2560.555-2.4162.506-1.6-4.256-2.962-1.284-4.256
26-1.156-2.9620.441-2.962-2.962-4.256-4.256-2.4160.488-2.4162.3290.488-4.256-4.256-1.6-4.256