We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZNF528
(GeneCards)
ModelZN528_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusnhhvRGGGAAGYCATTYCTbdbb
Best auROC (human)0.805
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words312
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyunclassified {2.3.3.0}
HGNCHGNC:29384
EntrezGeneGeneID:84436
(SSTAR profile)
UniProt IDZN528_HUMAN
UniProt ACQ3MIS6
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 0.13280999999999998
0.0005 3.0255599999999996
0.0001 9.29751
GTEx tissue expression atlas ZNF528 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF528 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0126.029.012.014.018.070.00.015.014.046.017.012.05.012.015.06.0
0222.014.016.011.019.0107.02.029.016.07.013.08.012.013.012.010.0
0331.013.018.07.018.0112.02.09.017.07.012.07.013.019.014.012.0
0453.03.017.06.0144.03.02.02.025.06.014.01.05.02.021.07.0
0522.01.0198.06.06.01.02.05.018.00.031.05.07.00.08.01.0
060.00.053.00.02.00.00.00.05.00.0234.00.05.00.011.01.0
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110.00.00.00.00.00.00.00.016.0159.020.0116.00.00.00.00.0
121.014.00.01.012.0146.00.01.01.018.00.01.013.0103.00.00.0
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141.022.02.0270.00.00.00.03.01.09.01.01.00.00.00.01.0
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2013.03.07.03.038.016.04.026.0103.011.026.06.019.010.013.013.0
2115.099.026.033.014.012.04.010.013.018.013.06.06.019.012.011.0
229.012.017.010.019.032.02.095.017.014.017.07.06.016.016.022.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.2860.394-0.471-0.321-0.0751.268-4.011-0.254-0.3210.851-0.131-0.471-1.307-0.471-0.254-1.136
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07-4.011-4.011-0.471-4.011-4.011-4.011-4.011-4.011-0.191-2.6792.651-2.679-4.011-4.011-2.679-4.011
08-0.191-4.011-4.011-4.011-2.679-4.011-4.011-4.0112.696-4.011-4.011-4.011-4.011-2.679-4.011-4.011
092.703-2.679-0.393-2.679-2.679-4.011-4.011-4.011-4.011-4.011-4.011-4.011-4.011-4.011-4.011-4.011
10-4.011-4.0112.706-4.011-4.011-4.011-2.679-4.011-4.011-4.011-0.393-4.011-4.011-4.011-2.679-4.011
11-4.011-4.011-4.011-4.011-4.011-4.011-4.011-4.011-0.1912.0860.0281.771-4.011-4.011-4.011-4.011
12-2.679-0.321-4.011-2.679-0.4712.001-4.011-2.679-2.679-0.075-4.011-2.679-0.3931.653-4.011-4.011
13-0.471-2.127-0.471-2.6792.651-2.679-4.011-4.011-4.011-4.011-4.011-4.011-1.774-4.011-4.011-4.011
14-2.6790.122-2.1272.614-4.011-4.011-4.011-1.774-2.679-0.749-2.679-2.679-4.011-4.011-4.011-2.679
15-4.011-4.011-4.011-2.127-2.679-2.127-4.0110.359-4.011-2.679-4.011-2.127-4.0110.551-1.5132.484
16-4.011-2.679-4.011-4.011-2.6790.165-1.307-0.862-4.011-2.679-1.774-4.011-2.6790.1650.2862.405
17-4.011-2.679-4.011-2.679-4.0110.851-4.011-2.127-2.6790.46-4.011-2.127-4.0112.419-4.011-1.307
18-4.011-2.679-4.011-4.011-2.6790.953-2.6792.525-4.011-4.011-4.011-4.011-4.011-2.127-4.011-0.862
19-2.679-4.011-4.011-4.011-0.8620.286-1.136-0.321-4.011-4.011-2.679-4.011-0.1311.0811.9520.737
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