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Model info
Transcription factorZNF528
(GeneCards)
ModelZN528_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusnhhvRGGGAAGYCATTYCTbdbb
Best auROC (human)0.805
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words312
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyunclassified {2.3.3.0}
HGNCHGNC:29384
EntrezGeneGeneID:84436
(SSTAR profile)
UniProt IDZN528_HUMAN
UniProt ACQ3MIS6
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
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0.0001 9.29751
GTEx tissue expression atlas ZNF528 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF528 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0126.029.012.014.018.070.00.015.014.046.017.012.05.012.015.06.0
0222.014.016.011.019.0107.02.029.016.07.013.08.012.013.012.010.0
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229.012.017.010.019.032.02.095.017.014.017.07.06.016.016.022.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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08-0.191-4.011-4.011-4.011-2.679-4.011-4.011-4.0112.696-4.011-4.011-4.011-4.011-2.679-4.011-4.011
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10-4.011-4.0112.706-4.011-4.011-4.011-2.679-4.011-4.011-4.011-0.393-4.011-4.011-4.011-2.679-4.011
11-4.011-4.011-4.011-4.011-4.011-4.011-4.011-4.011-0.1912.0860.0281.771-4.011-4.011-4.011-4.011
12-2.679-0.321-4.011-2.679-0.4712.001-4.011-2.679-2.679-0.075-4.011-2.679-0.3931.653-4.011-4.011
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