Check the newest release v12
Model info
Transcription factorZNF549
(GeneCards)
ModelZN549_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusdYYAKvRRhhGGRSAGShhhnnd
Best auROC (human)0.973
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)3
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words317
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyunclassified {2.3.3.0}
HGNCHGNC:26632
EntrezGeneGeneID:256051
(SSTAR profile)
UniProt IDZN549_HUMAN
UniProt ACQ6P9A3
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.919560000000001
0.0005 9.80461
0.0001 13.87971
GTEx tissue expression atlas ZNF549 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF549 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
018.06.04.030.05.04.00.032.03.010.06.035.09.013.019.0130.0
021.015.07.02.03.020.00.010.02.026.00.01.02.0175.07.043.0
038.00.00.00.0221.04.03.08.09.03.01.01.054.00.00.02.0
0413.011.085.0183.04.00.00.03.02.00.01.01.03.00.06.02.0
052.07.010.03.06.01.00.04.027.016.027.022.07.024.0149.09.0
0624.05.010.03.029.03.09.07.0119.019.036.012.016.05.012.05.0
07144.015.017.012.017.01.06.08.042.09.06.010.015.01.07.04.0
0835.086.013.084.01.016.02.07.02.09.04.021.03.06.06.019.0
099.02.01.029.048.021.00.048.09.03.04.09.013.038.08.072.0
1011.06.061.01.034.00.029.01.01.01.011.00.08.01.0143.06.0
113.05.043.03.02.00.00.06.019.09.0206.010.02.01.04.01.0
1214.02.010.00.07.02.01.05.052.018.0179.04.03.06.05.06.0
1312.045.014.05.06.014.02.06.03.0182.06.04.00.09.04.02.0
1414.01.01.05.0212.02.013.023.021.01.00.04.010.01.04.02.0
159.09.0237.02.00.00.02.03.00.04.012.02.02.020.09.03.0
164.05.00.02.03.04.014.012.04.0220.024.012.01.00.04.05.0
176.04.00.02.0134.045.015.035.018.06.02.016.014.02.013.02.0
1837.075.027.033.010.020.05.022.02.019.05.04.03.022.013.017.0
198.014.03.027.026.056.02.052.08.016.08.018.08.038.09.021.0
206.09.028.07.055.039.04.026.03.09.06.04.014.049.035.020.0
2130.016.026.06.056.024.01.025.010.027.028.08.08.013.020.016.0
2247.09.044.04.037.017.03.023.050.05.011.09.07.07.027.014.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.872-1.145-1.5230.418-1.316-1.523-4.0180.482-1.783-0.657-1.1450.571-0.759-0.403-0.0321.875
02-2.688-0.263-0.999-2.137-1.7830.019-4.018-0.657-2.1370.277-4.018-2.688-2.1372.172-0.9990.775
03-0.872-4.018-4.018-4.0182.405-1.523-1.783-0.872-0.759-1.783-2.688-2.6881.001-4.018-4.018-2.137
04-0.403-0.5651.4522.216-1.523-4.018-4.018-1.783-2.137-4.018-2.688-2.688-1.783-4.018-1.145-2.137
05-2.137-0.999-0.657-1.783-1.145-2.688-4.018-1.5230.314-0.20.3140.112-0.9990.1982.011-0.759
060.198-1.316-0.657-1.7830.385-1.783-0.759-0.9991.787-0.0320.599-0.481-0.2-1.316-0.481-1.316
071.977-0.263-0.141-0.481-0.141-2.688-1.145-0.8720.751-0.759-1.145-0.657-0.263-2.688-0.999-1.523
080.5711.464-0.4031.44-2.688-0.2-2.137-0.999-2.137-0.759-1.5230.067-1.783-1.145-1.145-0.032
09-0.759-2.137-2.6880.3850.8840.067-4.0180.884-0.759-1.783-1.523-0.759-0.4030.652-0.8721.287
10-0.565-1.1451.122-2.6880.542-4.0180.385-2.688-2.688-2.688-0.565-4.018-0.872-2.6881.97-1.145
11-1.783-1.3160.775-1.783-2.137-4.018-4.018-1.145-0.032-0.7592.335-0.657-2.137-2.688-1.523-2.688
12-0.331-2.137-0.657-4.018-0.999-2.137-2.688-1.3160.963-0.0852.194-1.523-1.783-1.145-1.316-1.145
13-0.4810.82-0.331-1.316-1.145-0.331-2.137-1.145-1.7832.211-1.145-1.523-4.018-0.759-1.523-2.137
14-0.331-2.688-2.688-1.3162.363-2.137-0.4030.1560.067-2.688-4.018-1.523-0.657-2.688-1.523-2.137
15-0.759-0.7592.475-2.137-4.018-4.018-2.137-1.783-4.018-1.523-0.481-2.137-2.1370.019-0.759-1.783
16-1.523-1.316-4.018-2.137-1.783-1.523-0.331-0.481-1.5232.40.198-0.481-2.688-4.018-1.523-1.316
17-1.145-1.523-4.018-2.1371.9060.82-0.2630.571-0.085-1.145-2.137-0.2-0.331-2.137-0.403-2.137
180.6261.3270.3140.512-0.6570.019-1.3160.112-2.137-0.032-1.316-1.523-1.7830.112-0.403-0.141
19-0.872-0.331-1.7830.3140.2771.037-2.1370.963-0.872-0.2-0.872-0.085-0.8720.652-0.7590.067
20-1.145-0.7590.35-0.9991.0190.678-1.5230.277-1.783-0.759-1.145-1.523-0.3310.9040.5710.019
210.418-0.20.277-1.1451.0370.198-2.6880.238-0.6570.3140.35-0.872-0.872-0.4030.019-0.2
220.863-0.7590.797-1.5230.626-0.141-1.7830.1560.924-1.316-0.565-0.759-0.999-0.9990.314-0.331