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Model info
Transcription factorZNF582
(GeneCards)
ModelZN582_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusWSKMWTGSWnTbGAATGSAAKYAWCRn
Best auROC (human)0.87
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)3
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words228
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF620-like factors {2.3.3.35}
HGNCHGNC:26421
EntrezGeneGeneID:147948
(SSTAR profile)
UniProt IDZN582_HUMAN
UniProt ACQ96NG8
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -7.8334399999999995
0.0005 -4.71584
0.0001 2.0641099999999994
GTEx tissue expression atlas ZNF582 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF582 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
013.035.035.01.07.02.00.00.05.02.02.01.015.077.034.07.0
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180.00.00.00.0112.00.01.00.0111.00.00.01.01.00.00.00.0
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210.035.02.05.00.00.00.00.00.04.09.057.04.0106.04.00.0
222.00.02.00.0143.00.01.01.012.02.01.00.061.00.00.01.0
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2412.092.011.09.04.02.00.00.00.04.00.00.00.087.01.04.0
256.02.06.02.0131.021.026.07.07.01.02.02.08.00.03.02.0
2613.041.049.049.04.020.00.00.031.02.04.00.01.01.011.00.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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03-0.081-2.38-1.466-2.38-1.822-3.754-2.38-3.7542.287-1.4660.341-2.38-2.380.921-2.38-2.38
042.307-3.754-0.678-0.825-1.466-3.754-2.380.9210.341-1.822-1.466-3.754-1.466-3.754-3.754-3.754
05-3.754-3.754-1.8222.46-3.754-3.754-3.754-1.822-3.754-3.754-1.822-0.437-1.466-3.7540.835-0.825
06-3.754-3.754-3.754-1.466-3.754-3.754-3.754-3.754-2.38-3.754-1.2040.805-1.822-3.7542.54-2.38
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08-3.754-3.754-1.822-3.7540.341-1.204-0.9970.9212.328-3.754-3.754-3.754-0.997-3.754-1.822-1.204
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10-1.204-2.38-3.7541.596-3.754-2.38-3.7541.001-2.38-2.38-3.7540.975-1.466-2.38-3.7541.523
11-3.754-2.38-0.997-1.822-3.754-2.38-1.466-3.754-3.754-3.754-3.754-3.754-0.0811.7271.2071.61
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20-0.159-3.7541.5232.0410.599-3.754-3.754-1.822-1.204-3.754-1.204-2.38-3.754-3.754-3.754-3.754
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22-1.822-3.754-1.822-3.7542.294-3.754-2.38-2.38-0.159-1.822-2.38-3.7541.445-3.754-3.754-2.38
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25-0.825-1.822-0.825-1.8222.2060.3890.599-0.678-0.678-2.38-1.822-1.822-0.551-3.754-1.466-1.822
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