We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZNF582
(GeneCards)
ModelZN582_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusWSKMWTGSWnTbGAATGSAAKYAWCRn
Best auROC (human)0.87
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)3
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words228
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF620-like factors {2.3.3.35}
HGNCHGNC:26421
EntrezGeneGeneID:147948
(SSTAR profile)
UniProt IDZN582_HUMAN
UniProt ACQ96NG8
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -7.8334399999999995
0.0005 -4.71584
0.0001 2.0641099999999994
GTEx tissue expression atlas ZNF582 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF582 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
013.035.035.01.07.02.00.00.05.02.02.01.015.077.034.07.0
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050.00.02.0169.00.00.00.02.00.00.02.09.03.00.033.06.0
060.00.00.03.00.00.00.00.01.00.04.032.02.00.0183.01.0
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080.00.02.00.020.04.05.036.0148.00.00.00.05.00.02.04.0
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110.01.05.02.00.01.03.00.00.00.00.00.013.081.048.072.0
121.00.012.00.014.00.067.02.01.01.054.00.07.00.067.00.0
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160.00.03.00.00.00.07.00.00.00.01.00.011.00.0204.00.0
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180.00.00.00.0112.00.01.00.0111.00.00.01.01.00.00.00.0
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210.035.02.05.00.00.00.00.00.04.09.057.04.0106.04.00.0
222.00.02.00.0143.00.01.01.012.02.01.00.061.00.00.01.0
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2412.092.011.09.04.02.00.00.00.04.00.00.00.087.01.04.0
256.02.06.02.0131.021.026.07.07.01.02.02.08.00.03.02.0
2613.041.049.049.04.020.00.00.031.02.04.00.01.01.011.00.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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02-1.466-1.8220.52-2.38-0.081-3.7541.5080.975-1.822-2.381.553-3.754-3.754-3.754-0.437-3.754
03-0.081-2.38-1.466-2.38-1.822-3.754-2.38-3.7542.287-1.4660.341-2.38-2.380.921-2.38-2.38
042.307-3.754-0.678-0.825-1.466-3.754-2.380.9210.341-1.822-1.466-3.754-1.466-3.754-3.754-3.754
05-3.754-3.754-1.8222.46-3.754-3.754-3.754-1.822-3.754-3.754-1.822-0.437-1.466-3.7540.835-0.825
06-3.754-3.754-3.754-1.466-3.754-3.754-3.754-3.754-2.38-3.754-1.2040.805-1.822-3.7542.54-2.38
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08-3.754-3.754-1.822-3.7540.341-1.204-0.9970.9212.328-3.754-3.754-3.754-0.997-3.754-1.822-1.204
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10-1.204-2.38-3.7541.596-3.754-2.38-3.7541.001-2.38-2.38-3.7540.975-1.466-2.38-3.7541.523
11-3.754-2.38-0.997-1.822-3.754-2.38-1.466-3.754-3.754-3.754-3.754-3.754-0.0811.7271.2071.61
12-2.38-3.754-0.159-3.754-0.009-3.7541.538-1.822-2.38-2.381.324-3.754-0.678-3.7541.538-3.754
13-3.754-3.7540.478-3.754-3.754-3.754-3.754-2.382.341-3.7541.247-3.754-1.822-3.754-3.754-3.754
142.354-3.754-3.754-3.754-3.754-3.754-3.754-3.754-2.381.596-3.754-2.38-3.754-2.38-3.754-3.754
15-3.754-0.678-3.7542.314-1.466-3.754-2.381.553-3.754-3.754-3.754-3.754-3.754-3.754-3.754-2.38
16-3.754-3.754-1.466-3.754-3.754-3.754-0.678-3.754-3.754-3.754-2.38-3.754-0.243-3.7542.648-3.754
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192.5670.637-0.437-3.754-3.754-3.754-3.754-3.754-3.754-2.38-3.754-3.754-2.38-3.754-3.754-3.754
20-0.159-3.7541.5232.0410.599-3.754-3.754-1.822-1.204-3.754-1.204-2.38-3.754-3.754-3.754-3.754
21-3.7540.893-1.822-0.997-3.754-3.754-3.754-3.754-3.754-1.204-0.4371.377-1.2041.995-1.204-3.754
22-1.822-3.754-1.822-3.7542.294-3.754-2.38-2.38-0.159-1.822-2.38-3.7541.445-3.754-3.754-2.38
232.11-1.204-1.4661.854-1.822-3.754-3.754-3.754-1.822-2.38-2.38-3.754-2.38-2.38-3.754-3.754
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