We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZNF680
(GeneCards)
ModelZN680_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusTTGTCCYRYGWCCARGAAGAATR
Best auROC (human)0.989
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)3
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words422
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyunclassified {2.3.3.0}
HGNCHGNC:26897
EntrezGeneGeneID:340252
(SSTAR profile)
UniProt IDZN680_HUMAN
UniProt ACQ8NEM1
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -11.74894
0.0005 -8.353839999999998
0.0001 -0.93624
GTEx tissue expression atlas ZNF680 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF680 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
011.00.00.00.01.00.00.07.02.01.01.07.01.04.00.0397.0
021.00.04.00.01.01.02.01.01.00.00.00.02.01.0407.01.0
031.00.01.03.00.00.00.02.00.07.01.0405.00.00.01.01.0
040.01.00.00.00.05.00.02.01.02.00.00.012.0396.01.02.0
050.013.00.00.00.0309.01.094.00.00.01.00.00.03.01.00.0
060.00.00.00.016.0226.01.082.00.02.01.00.00.085.07.02.0
070.01.014.01.0266.05.034.08.00.00.09.00.09.01.074.00.0
085.0124.07.0139.00.04.00.03.03.054.02.072.01.05.01.02.0
090.00.09.00.0132.01.053.01.03.00.07.00.011.00.0205.00.0
1040.015.07.084.00.00.00.01.078.033.011.0152.00.01.00.00.0
111.0113.00.04.00.047.00.02.00.017.00.01.00.0227.01.09.0
120.01.00.00.012.0374.00.018.00.01.00.00.01.014.01.00.0
1310.01.02.00.0384.02.04.00.01.00.00.00.011.00.06.01.0
14221.03.0171.011.03.00.00.00.05.00.06.01.00.00.00.01.0
150.00.0229.00.00.00.03.00.00.00.0177.00.00.00.013.00.0
160.00.00.00.00.00.00.00.0422.00.00.00.00.00.00.00.0
17387.00.034.01.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
1846.01.0336.04.00.00.00.00.04.00.026.04.00.00.01.00.0
1950.00.00.00.01.00.00.00.0362.01.00.00.08.00.00.00.0
20376.08.03.034.01.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
212.07.02.0366.01.00.00.07.00.00.01.02.00.02.00.032.0
220.00.03.00.06.01.00.02.01.00.02.00.062.08.0282.055.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-2.966-4.26-4.26-4.26-2.966-4.26-4.26-1.288-2.42-2.966-2.966-1.288-2.966-1.81-4.262.698
02-2.966-4.26-1.81-4.26-2.966-2.966-2.42-2.966-2.966-4.26-4.26-4.26-2.42-2.9662.723-2.966
03-2.966-4.26-2.966-2.069-4.26-4.26-4.26-2.42-4.26-1.288-2.9662.718-4.26-4.26-2.966-2.966
04-4.26-2.966-4.26-4.26-4.26-1.604-4.26-2.42-2.966-2.42-4.26-4.26-0.7712.696-2.966-2.42
05-4.26-0.693-4.26-4.26-4.262.448-2.9661.261-4.26-4.26-2.966-4.26-4.26-2.069-2.966-4.26
06-4.26-4.26-4.26-4.26-0.4912.136-2.9661.125-4.26-2.42-2.966-4.26-4.261.16-1.288-2.42
07-4.26-2.966-0.621-2.9662.298-1.6040.251-1.161-4.26-4.26-1.048-4.26-1.048-2.9661.023-4.26
08-1.6041.537-1.2881.651-4.26-1.81-4.26-2.069-2.0690.709-2.420.995-2.966-1.604-2.966-2.42
09-4.26-4.26-1.048-4.261.599-2.9660.691-2.966-2.069-4.26-1.288-4.26-0.855-4.262.038-4.26
100.412-0.554-1.2881.149-4.26-4.26-4.26-2.9661.0750.221-0.8551.74-4.26-2.966-4.26-4.26
11-2.9661.444-4.26-1.81-4.260.572-4.26-2.42-4.26-0.431-4.26-2.966-4.262.14-2.966-1.048
12-4.26-2.966-4.26-4.26-0.7712.639-4.26-0.375-4.26-2.966-4.26-4.26-2.966-0.621-2.966-4.26
13-0.947-2.966-2.42-4.262.665-2.42-1.81-4.26-2.966-4.26-4.26-4.26-0.855-4.26-1.434-2.966
142.113-2.0691.857-0.855-2.069-4.26-4.26-4.26-1.604-4.26-1.434-2.966-4.26-4.26-4.26-2.966
15-4.26-4.262.149-4.26-4.26-4.26-2.069-4.26-4.26-4.261.892-4.26-4.26-4.26-0.693-4.26
16-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.262.759-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26
172.673-4.260.251-2.966-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26
180.55-2.9662.532-1.81-4.26-4.26-4.26-4.26-1.81-4.26-0.014-1.81-4.26-4.26-2.966-4.26
190.633-4.26-4.26-4.26-2.966-4.26-4.26-4.262.606-2.966-4.26-4.26-1.161-4.26-4.26-4.26
202.644-1.161-2.0690.251-2.966-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26
21-2.42-1.288-2.422.617-2.966-4.26-4.26-1.288-4.26-4.26-2.966-2.42-4.26-2.42-4.260.191
22-4.26-4.26-2.069-4.26-1.434-2.966-4.26-2.42-2.966-4.26-2.42-4.260.847-1.1612.3570.728