We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZNF41
(GeneCards)
ModelZNF41_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusvRMRRGRRARhvvRvSACMAWSRKbnR
Best auROC (human)0.919
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words335
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZFN81-like factors {2.3.3.68}
HGNCHGNC:13107
EntrezGeneGeneID:7592
(SSTAR profile)
UniProt IDZNF41_HUMAN
UniProt ACP51814
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 5.397259999999999
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0.0001 12.577560000000002
GTEx tissue expression atlas ZNF41 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF41 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0138.014.024.07.0144.013.02.06.028.05.08.04.018.010.011.03.0
0214.0192.07.015.020.04.07.011.06.026.08.05.01.06.06.07.0
0312.014.011.04.0198.06.010.014.016.01.09.02.010.05.019.04.0
04170.03.058.05.016.02.00.08.024.01.023.01.09.00.014.01.0
0515.00.0195.09.01.00.04.01.016.03.070.06.02.02.011.00.0
0611.06.015.02.05.00.00.00.021.010.0230.019.04.01.011.00.0
0713.00.027.01.09.01.05.02.0104.05.0146.01.05.00.016.00.0
08123.02.05.01.04.00.00.02.0188.00.03.03.02.00.01.01.0
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1046.044.012.048.012.02.00.04.027.023.014.0100.02.00.01.00.0
1129.021.027.010.045.07.05.012.09.08.06.04.070.023.029.030.0
1284.022.034.013.043.04.06.06.023.020.016.08.013.08.031.04.0
1351.09.089.014.038.01.09.06.033.03.046.05.09.01.017.04.0
1437.017.067.010.07.03.02.02.045.051.049.016.04.06.011.08.0
152.065.015.011.06.062.03.06.04.090.028.07.03.024.03.06.0
1615.00.00.00.0240.00.01.00.047.00.02.00.025.01.04.00.0
177.0300.016.04.00.01.00.00.00.02.04.01.00.00.00.00.0
183.01.02.01.059.0231.00.013.013.04.02.01.04.00.00.01.0
1947.02.027.03.0227.05.03.01.01.00.02.01.07.00.08.01.0
2027.08.020.0227.04.01.01.01.09.05.08.018.02.00.01.03.0
215.06.029.02.06.03.01.04.05.05.017.03.020.032.0185.012.0
2225.00.011.00.038.01.02.05.0176.012.017.027.010.00.09.02.0
2321.016.0183.029.05.04.04.00.07.07.018.07.02.05.022.05.0
248.01.019.07.06.06.02.018.036.040.0104.047.00.019.011.011.0
2511.07.028.04.039.06.09.012.040.015.070.011.012.014.042.015.0
2685.04.010.03.017.013.04.08.0109.015.013.012.011.04.022.05.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.588-0.3940.134-1.0621.914-0.466-2.199-1.2080.286-1.379-0.935-1.586-0.148-0.72-0.628-1.846
02-0.3942.201-1.062-0.327-0.045-1.586-1.062-0.628-1.2080.213-0.935-1.379-2.749-1.208-1.208-1.062
03-0.544-0.394-0.628-1.5862.231-1.208-0.72-0.394-0.264-2.749-0.822-2.199-0.72-1.379-0.095-1.586
042.079-1.8461.008-1.379-0.264-2.199-4.071-0.9350.134-2.7490.092-2.749-0.822-4.071-0.394-2.749
05-0.327-4.0712.216-0.822-2.749-4.071-1.586-2.749-0.264-1.8461.195-1.208-2.199-2.199-0.628-4.071
06-0.628-1.208-0.327-2.199-1.379-4.071-4.071-4.0710.003-0.722.381-0.095-1.586-2.749-0.628-4.071
07-0.466-4.0710.25-2.749-0.822-2.749-1.379-2.1991.589-1.3791.927-2.749-1.379-4.071-0.264-4.071
081.756-2.199-1.379-2.749-1.586-4.071-4.071-2.1992.18-4.071-1.846-1.846-2.199-4.071-2.749-2.749
091.893-0.2642.0-1.846-2.199-4.071-4.071-4.071-1.208-4.071-1.846-4.071-2.749-2.199-1.586-4.071
100.7780.734-0.5440.82-0.544-2.199-4.071-1.5860.250.092-0.3941.55-2.199-4.071-2.749-4.071
110.3210.0030.25-0.720.756-1.062-1.379-0.544-0.822-0.935-1.208-1.5861.1950.0920.3210.354
121.3760.0490.478-0.4660.711-1.586-1.208-1.2080.092-0.045-0.264-0.935-0.466-0.9350.387-1.586
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140.562-0.2041.151-0.72-1.062-1.846-2.199-2.1990.7560.880.84-0.264-1.586-1.208-0.628-0.935
15-2.1991.121-0.327-0.628-1.2081.074-1.846-1.208-1.5861.4450.286-1.062-1.8460.134-1.846-1.208
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17-1.0622.646-0.264-1.586-4.071-2.749-4.071-4.071-4.071-2.199-1.586-2.749-4.071-4.071-4.071-4.071
18-1.846-2.749-2.199-2.7491.0252.385-4.071-0.466-0.466-1.586-2.199-2.749-1.586-4.071-4.071-2.749
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21-1.379-1.2080.321-2.199-1.208-1.846-2.749-1.586-1.379-1.379-0.204-1.846-0.0450.4182.164-0.544
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