We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZNF85
(GeneCards)
ModelZNF85_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusYAAYAGAMRWYTGMAGWAATCTY
Best auROC (human)0.908
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words199
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyunclassified {2.3.3.0}
HGNCHGNC:13160
EntrezGeneGeneID:7639
(SSTAR profile)
UniProt IDZNF85_HUMAN
UniProt ACQ03923
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 0.82111
0.0005 3.58946
0.0001 9.57151
GTEx tissue expression atlas ZNF85 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF85 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
016.04.03.03.027.03.00.01.04.02.01.01.0133.03.05.03.0
02146.02.017.05.06.02.01.03.05.00.04.00.03.01.01.03.0
0315.015.06.0124.02.01.00.02.03.04.05.011.00.02.03.06.0
0417.00.01.02.019.00.00.03.010.00.01.03.0132.01.07.03.0
0517.02.0156.03.01.00.00.00.01.00.07.01.03.00.08.00.0
0619.01.02.00.01.01.00.00.0167.01.01.02.04.00.00.00.0
07135.040.010.06.03.00.00.00.03.00.00.00.02.00.00.00.0
0871.00.071.01.038.00.01.01.06.01.03.00.02.00.04.00.0
0977.01.06.033.00.01.00.00.068.03.01.07.00.00.01.01.0
1011.0105.011.018.01.04.00.00.01.06.00.01.02.037.01.01.0
113.00.01.011.02.02.01.0147.03.01.00.08.02.00.04.014.0
121.00.09.00.02.00.01.00.02.00.04.00.014.00.0166.00.0
1319.00.00.00.00.00.00.00.0116.060.01.03.00.00.00.00.0
14121.05.04.05.039.00.02.019.00.00.00.01.00.00.00.03.0
156.00.0152.02.01.00.04.00.00.00.06.00.00.00.028.00.0
160.00.00.07.00.00.00.00.034.06.020.0130.00.00.00.02.0
1734.00.00.00.06.00.00.00.020.00.00.00.0139.00.00.00.0
18168.029.01.01.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
192.04.02.0160.00.00.00.029.00.00.00.01.00.00.00.01.0
200.01.00.01.00.04.00.00.01.01.00.00.03.0177.03.08.0
211.01.00.02.012.019.01.0151.00.00.00.03.01.01.00.07.0
224.03.04.03.04.09.00.08.00.00.00.01.04.048.010.0101.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.702-1.081-1.344-1.3440.761-1.344-3.653-2.261-1.081-1.701-2.261-2.2612.346-1.344-0.873-1.344
022.439-1.7010.306-0.873-0.702-1.701-2.261-1.344-0.873-3.653-1.081-3.653-1.344-2.261-2.261-1.344
030.1830.183-0.7022.276-1.701-2.261-3.653-1.701-1.344-1.081-0.873-0.119-3.653-1.701-1.344-0.702
040.306-3.653-2.261-1.7010.415-3.653-3.653-1.344-0.212-3.653-2.261-1.3442.338-2.261-0.555-1.344
050.306-1.7012.505-1.344-2.261-3.653-3.653-3.653-2.261-3.653-0.555-2.261-1.344-3.653-0.427-3.653
060.415-2.261-1.701-3.653-2.261-2.261-3.653-3.6532.573-2.261-2.261-1.701-1.081-3.653-3.653-3.653
072.3611.15-0.212-0.702-1.344-3.653-3.653-3.653-1.344-3.653-3.653-3.653-1.701-3.653-3.653-3.653
081.72-3.6531.72-2.2611.099-3.653-2.261-2.261-0.702-2.261-1.344-3.653-1.701-3.653-1.081-3.653
091.801-2.261-0.7020.96-3.653-2.261-3.653-3.6531.677-1.344-2.261-0.555-3.653-3.653-2.261-2.261
10-0.1192.11-0.1190.362-2.261-1.081-3.653-3.653-2.261-0.702-3.653-2.261-1.7011.073-2.261-2.261
11-1.344-3.653-2.261-0.119-1.701-1.701-2.2612.446-1.344-2.261-3.653-0.427-1.701-3.653-1.0810.115
12-2.261-3.653-0.314-3.653-1.701-3.653-2.261-3.653-1.701-3.653-1.081-3.6530.115-3.6532.567-3.653
130.415-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653-3.6532.2091.553-2.261-1.344-3.653-3.653-3.653-3.653
142.252-0.873-1.081-0.8731.125-3.653-1.7010.415-3.653-3.653-3.653-2.261-3.653-3.653-3.653-1.344
15-0.702-3.6532.479-1.701-2.261-3.653-1.081-3.653-3.653-3.653-0.702-3.653-3.653-3.6530.797-3.653
16-3.653-3.653-3.653-0.555-3.653-3.653-3.653-3.6530.989-0.7020.4652.323-3.653-3.653-3.653-1.701
170.989-3.653-3.653-3.653-0.702-3.653-3.653-3.6530.465-3.653-3.653-3.6532.39-3.653-3.653-3.653
182.5790.832-2.261-2.261-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653
19-1.701-1.081-1.7012.53-3.653-3.653-3.6530.832-3.653-3.653-3.653-2.261-3.653-3.653-3.653-2.261
20-3.653-2.261-3.653-2.261-3.653-1.081-3.653-3.653-2.261-2.261-3.653-3.653-1.3442.631-1.344-0.427
21-2.261-2.261-3.653-1.701-0.0350.415-2.2612.473-3.653-3.653-3.653-1.344-2.261-2.261-3.653-0.555
22-1.081-1.344-1.081-1.344-1.081-0.314-3.653-0.427-3.653-3.653-3.653-2.261-1.0811.331-0.2122.071