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Model info
Transcription factorZNF85
(GeneCards)
ModelZNF85_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusYAAYAGAMRWYTGMAGWAATCTY
Best auROC (human)0.908
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words199
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyunclassified {2.3.3.0}
HGNCHGNC:13160
EntrezGeneGeneID:7639
(SSTAR profile)
UniProt IDZNF85_HUMAN
UniProt ACQ03923
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 0.82111
0.0005 3.58946
0.0001 9.57151
GTEx tissue expression atlas ZNF85 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF85 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
016.04.03.03.027.03.00.01.04.02.01.01.0133.03.05.03.0
02146.02.017.05.06.02.01.03.05.00.04.00.03.01.01.03.0
0315.015.06.0124.02.01.00.02.03.04.05.011.00.02.03.06.0
0417.00.01.02.019.00.00.03.010.00.01.03.0132.01.07.03.0
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113.00.01.011.02.02.01.0147.03.01.00.08.02.00.04.014.0
121.00.09.00.02.00.01.00.02.00.04.00.014.00.0166.00.0
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156.00.0152.02.01.00.04.00.00.00.06.00.00.00.028.00.0
160.00.00.07.00.00.00.00.034.06.020.0130.00.00.00.02.0
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192.04.02.0160.00.00.00.029.00.00.00.01.00.00.00.01.0
200.01.00.01.00.04.00.00.01.01.00.00.03.0177.03.08.0
211.01.00.02.012.019.01.0151.00.00.00.03.01.01.00.07.0
224.03.04.03.04.09.00.08.00.00.00.01.04.048.010.0101.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.702-1.081-1.344-1.3440.761-1.344-3.653-2.261-1.081-1.701-2.261-2.2612.346-1.344-0.873-1.344
022.439-1.7010.306-0.873-0.702-1.701-2.261-1.344-0.873-3.653-1.081-3.653-1.344-2.261-2.261-1.344
030.1830.183-0.7022.276-1.701-2.261-3.653-1.701-1.344-1.081-0.873-0.119-3.653-1.701-1.344-0.702
040.306-3.653-2.261-1.7010.415-3.653-3.653-1.344-0.212-3.653-2.261-1.3442.338-2.261-0.555-1.344
050.306-1.7012.505-1.344-2.261-3.653-3.653-3.653-2.261-3.653-0.555-2.261-1.344-3.653-0.427-3.653
060.415-2.261-1.701-3.653-2.261-2.261-3.653-3.6532.573-2.261-2.261-1.701-1.081-3.653-3.653-3.653
072.3611.15-0.212-0.702-1.344-3.653-3.653-3.653-1.344-3.653-3.653-3.653-1.701-3.653-3.653-3.653
081.72-3.6531.72-2.2611.099-3.653-2.261-2.261-0.702-2.261-1.344-3.653-1.701-3.653-1.081-3.653
091.801-2.261-0.7020.96-3.653-2.261-3.653-3.6531.677-1.344-2.261-0.555-3.653-3.653-2.261-2.261
10-0.1192.11-0.1190.362-2.261-1.081-3.653-3.653-2.261-0.702-3.653-2.261-1.7011.073-2.261-2.261
11-1.344-3.653-2.261-0.119-1.701-1.701-2.2612.446-1.344-2.261-3.653-0.427-1.701-3.653-1.0810.115
12-2.261-3.653-0.314-3.653-1.701-3.653-2.261-3.653-1.701-3.653-1.081-3.6530.115-3.6532.567-3.653
130.415-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653-3.6532.2091.553-2.261-1.344-3.653-3.653-3.653-3.653
142.252-0.873-1.081-0.8731.125-3.653-1.7010.415-3.653-3.653-3.653-2.261-3.653-3.653-3.653-1.344
15-0.702-3.6532.479-1.701-2.261-3.653-1.081-3.653-3.653-3.653-0.702-3.653-3.653-3.6530.797-3.653
16-3.653-3.653-3.653-0.555-3.653-3.653-3.653-3.6530.989-0.7020.4652.323-3.653-3.653-3.653-1.701
170.989-3.653-3.653-3.653-0.702-3.653-3.653-3.6530.465-3.653-3.653-3.6532.39-3.653-3.653-3.653
182.5790.832-2.261-2.261-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653-3.653
19-1.701-1.081-1.7012.53-3.653-3.653-3.6530.832-3.653-3.653-3.653-2.261-3.653-3.653-3.653-2.261
20-3.653-2.261-3.653-2.261-3.653-1.081-3.653-3.653-2.261-2.261-3.653-3.653-1.3442.631-1.344-0.427
21-2.261-2.261-3.653-1.701-0.0350.415-2.2612.473-3.653-3.653-3.653-1.344-2.261-2.261-3.653-0.555
22-1.081-1.344-1.081-1.344-1.081-0.314-3.653-0.427-3.653-3.653-3.653-2.261-1.0811.331-0.2122.071