Check the newest release v13
Model info
Transcription factorZNF8
(GeneCards)
ModelZNF8_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length25
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusTGTGGTAYATCCATWCAATGGAATA
Best auROC (human)0.989
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)3
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words400
TF familyFactors with multiple dispersed zinc fingers {2.3.4}
TF subfamilyunclassified {2.3.4.0}
HGNCHGNC:13154
EntrezGeneGeneID:7554
(SSTAR profile)
UniProt IDZNF8_HUMAN
UniProt ACP17098
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -12.05949
0.0005 -8.886589999999998
0.0001 -1.9276900000000001
GTEx tissue expression atlas ZNF8 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF8 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
019.01.02.00.07.03.010.00.04.01.08.00.039.06.0305.02.0
020.04.00.055.00.02.00.09.02.08.00.0315.00.00.00.02.0
030.00.02.00.00.00.013.01.00.00.00.00.00.00.0381.00.0
040.00.00.00.00.00.00.00.02.00.0394.00.00.00.01.00.0
050.00.00.02.00.00.00.00.07.016.00.0372.00.00.00.00.0
067.00.00.00.016.00.00.00.00.00.00.00.0372.02.00.00.0
075.0116.04.0270.00.00.00.02.00.00.00.00.00.00.00.00.0
083.01.00.01.0107.00.09.00.03.00.01.00.0215.08.049.00.0
091.09.08.0310.08.00.00.01.02.06.00.051.00.00.01.00.0
101.04.00.06.04.011.00.00.01.06.01.01.044.0310.07.01.0
110.08.00.042.03.0290.00.038.00.02.00.06.00.07.00.01.0
123.00.00.00.0300.02.01.04.00.00.00.00.083.00.04.00.0
134.055.011.0316.00.00.00.02.00.00.00.05.00.00.00.04.0
143.00.01.00.045.02.05.03.08.00.01.02.0241.07.037.042.0
1516.0237.04.040.04.03.02.00.02.034.01.07.04.041.02.00.0
1622.02.00.02.0269.033.09.04.09.00.00.00.034.06.07.00.0
17259.07.056.012.035.01.05.00.012.00.03.01.04.00.02.00.0
1816.017.08.0269.00.01.00.07.00.04.02.060.01.01.08.03.0
193.00.011.03.014.00.07.02.02.00.014.02.019.03.0313.04.0
203.01.032.02.02.01.00.00.024.00.0319.02.00.02.09.00.0
2123.00.03.03.02.01.01.00.0344.05.09.02.01.00.02.01.0
22311.015.039.05.05.01.00.00.010.01.01.03.04.01.00.01.0
239.08.00.0313.03.02.00.013.01.02.00.037.09.00.00.00.0
248.03.01.010.010.01.00.01.00.00.00.00.0346.02.011.04.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.988-2.909-2.362-4.21-1.228-2.01-0.887-4.21-1.751-2.909-1.101-4.210.447-1.3742.495-2.362
02-4.21-1.751-4.210.788-4.21-2.362-4.21-0.988-2.362-1.101-4.212.527-4.21-4.21-4.21-2.362
03-4.21-4.21-2.362-4.21-4.21-4.21-0.633-2.909-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-4.212.717-4.21
04-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-2.362-4.212.751-4.21-4.21-4.21-2.909-4.21
05-4.21-4.21-4.21-2.362-4.21-4.21-4.21-4.21-1.228-0.431-4.212.694-4.21-4.21-4.21-4.21
06-1.228-4.21-4.21-4.21-0.431-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-4.212.694-2.362-4.21-4.21
07-1.5451.531-1.7512.373-4.21-4.21-4.21-2.362-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21
08-2.01-2.909-4.21-2.9091.45-4.21-0.988-4.21-2.01-4.21-2.909-4.212.146-1.1010.673-4.21
09-2.909-0.988-1.1012.511-1.101-4.21-4.21-2.909-2.362-1.374-4.210.713-4.21-4.21-2.909-4.21
10-2.909-1.751-4.21-1.374-1.751-0.795-4.21-4.21-2.909-1.374-2.909-2.9090.5662.511-1.228-2.909
11-4.21-1.101-4.210.52-2.012.445-4.210.421-4.21-2.362-4.21-1.374-4.21-1.228-4.21-2.909
12-2.01-4.21-4.21-4.212.479-2.362-2.909-1.751-4.21-4.21-4.21-4.211.197-4.21-1.751-4.21
13-1.7510.788-0.7952.531-4.21-4.21-4.21-2.362-4.21-4.21-4.21-1.545-4.21-4.21-4.21-1.751
14-2.01-4.21-2.909-4.210.589-2.362-1.545-2.01-1.101-4.21-2.909-2.3622.26-1.2280.3950.52
15-0.4312.243-1.7510.472-1.751-2.01-2.362-4.21-2.3620.311-2.909-1.228-1.7510.496-2.362-4.21
16-0.118-2.362-4.21-2.3622.370.281-0.988-1.751-0.988-4.21-4.21-4.210.311-1.374-1.228-4.21
172.332-1.2280.806-0.7110.34-2.909-1.545-4.21-0.711-4.21-2.01-2.909-1.751-4.21-2.362-4.21
18-0.431-0.371-1.1012.37-4.21-2.909-4.21-1.228-4.21-1.751-2.3620.874-2.909-2.909-1.101-2.01
19-2.01-4.21-0.795-2.01-0.561-4.21-1.228-2.362-2.362-4.21-0.561-2.362-0.262-2.012.521-1.751
20-2.01-2.9090.251-2.362-2.362-2.909-4.21-4.21-0.033-4.212.54-2.362-4.21-2.362-0.988-4.21
21-0.075-4.21-2.01-2.01-2.362-2.909-2.909-4.212.615-1.545-0.988-2.362-2.909-4.21-2.362-2.909
222.515-0.4940.447-1.545-1.545-2.909-4.21-4.21-0.887-2.909-2.909-2.01-1.751-2.909-4.21-2.909
23-0.988-1.101-4.212.521-2.01-2.362-4.21-0.633-2.909-2.362-4.210.395-0.988-4.21-4.21-4.21
24-1.101-2.01-2.909-0.887-0.887-2.909-4.21-2.909-4.21-4.21-4.21-4.212.621-2.362-0.795-1.751