We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZNF8
(GeneCards)
ModelZNF8_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length25
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusTGTGGTAYATCCATWCAATGGAATA
Best auROC (human)0.989
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)3
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words400
TF familyFactors with multiple dispersed zinc fingers {2.3.4}
TF subfamilyunclassified {2.3.4.0}
HGNCHGNC:13154
EntrezGeneGeneID:7554
(SSTAR profile)
UniProt IDZNF8_HUMAN
UniProt ACP17098
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -12.05949
0.0005 -8.886589999999998
0.0001 -1.9276900000000001
GTEx tissue expression atlas ZNF8 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF8 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
019.01.02.00.07.03.010.00.04.01.08.00.039.06.0305.02.0
020.04.00.055.00.02.00.09.02.08.00.0315.00.00.00.02.0
030.00.02.00.00.00.013.01.00.00.00.00.00.00.0381.00.0
040.00.00.00.00.00.00.00.02.00.0394.00.00.00.01.00.0
050.00.00.02.00.00.00.00.07.016.00.0372.00.00.00.00.0
067.00.00.00.016.00.00.00.00.00.00.00.0372.02.00.00.0
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083.01.00.01.0107.00.09.00.03.00.01.00.0215.08.049.00.0
091.09.08.0310.08.00.00.01.02.06.00.051.00.00.01.00.0
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110.08.00.042.03.0290.00.038.00.02.00.06.00.07.00.01.0
123.00.00.00.0300.02.01.04.00.00.00.00.083.00.04.00.0
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143.00.01.00.045.02.05.03.08.00.01.02.0241.07.037.042.0
1516.0237.04.040.04.03.02.00.02.034.01.07.04.041.02.00.0
1622.02.00.02.0269.033.09.04.09.00.00.00.034.06.07.00.0
17259.07.056.012.035.01.05.00.012.00.03.01.04.00.02.00.0
1816.017.08.0269.00.01.00.07.00.04.02.060.01.01.08.03.0
193.00.011.03.014.00.07.02.02.00.014.02.019.03.0313.04.0
203.01.032.02.02.01.00.00.024.00.0319.02.00.02.09.00.0
2123.00.03.03.02.01.01.00.0344.05.09.02.01.00.02.01.0
22311.015.039.05.05.01.00.00.010.01.01.03.04.01.00.01.0
239.08.00.0313.03.02.00.013.01.02.00.037.09.00.00.00.0
248.03.01.010.010.01.00.01.00.00.00.00.0346.02.011.04.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.988-2.909-2.362-4.21-1.228-2.01-0.887-4.21-1.751-2.909-1.101-4.210.447-1.3742.495-2.362
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03-4.21-4.21-2.362-4.21-4.21-4.21-0.633-2.909-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-4.212.717-4.21
04-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-2.362-4.212.751-4.21-4.21-4.21-2.909-4.21
05-4.21-4.21-4.21-2.362-4.21-4.21-4.21-4.21-1.228-0.431-4.212.694-4.21-4.21-4.21-4.21
06-1.228-4.21-4.21-4.21-0.431-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-4.212.694-2.362-4.21-4.21
07-1.5451.531-1.7512.373-4.21-4.21-4.21-2.362-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21-4.21
08-2.01-2.909-4.21-2.9091.45-4.21-0.988-4.21-2.01-4.21-2.909-4.212.146-1.1010.673-4.21
09-2.909-0.988-1.1012.511-1.101-4.21-4.21-2.909-2.362-1.374-4.210.713-4.21-4.21-2.909-4.21
10-2.909-1.751-4.21-1.374-1.751-0.795-4.21-4.21-2.909-1.374-2.909-2.9090.5662.511-1.228-2.909
11-4.21-1.101-4.210.52-2.012.445-4.210.421-4.21-2.362-4.21-1.374-4.21-1.228-4.21-2.909
12-2.01-4.21-4.21-4.212.479-2.362-2.909-1.751-4.21-4.21-4.21-4.211.197-4.21-1.751-4.21
13-1.7510.788-0.7952.531-4.21-4.21-4.21-2.362-4.21-4.21-4.21-1.545-4.21-4.21-4.21-1.751
14-2.01-4.21-2.909-4.210.589-2.362-1.545-2.01-1.101-4.21-2.909-2.3622.26-1.2280.3950.52
15-0.4312.243-1.7510.472-1.751-2.01-2.362-4.21-2.3620.311-2.909-1.228-1.7510.496-2.362-4.21
16-0.118-2.362-4.21-2.3622.370.281-0.988-1.751-0.988-4.21-4.21-4.210.311-1.374-1.228-4.21
172.332-1.2280.806-0.7110.34-2.909-1.545-4.21-0.711-4.21-2.01-2.909-1.751-4.21-2.362-4.21
18-0.431-0.371-1.1012.37-4.21-2.909-4.21-1.228-4.21-1.751-2.3620.874-2.909-2.909-1.101-2.01
19-2.01-4.21-0.795-2.01-0.561-4.21-1.228-2.362-2.362-4.21-0.561-2.362-0.262-2.012.521-1.751
20-2.01-2.9090.251-2.362-2.362-2.909-4.21-4.21-0.033-4.212.54-2.362-4.21-2.362-0.988-4.21
21-0.075-4.21-2.01-2.01-2.362-2.909-2.909-4.212.615-1.545-0.988-2.362-2.909-4.21-2.362-2.909
222.515-0.4940.447-1.545-1.545-2.909-4.21-4.21-0.887-2.909-2.909-2.01-1.751-2.909-4.21-2.909
23-0.988-1.101-4.212.521-2.01-2.362-4.21-0.633-2.909-2.362-4.210.395-0.988-4.21-4.21-4.21
24-1.101-2.01-2.909-0.887-0.887-2.909-4.21-2.909-4.21-4.21-4.21-4.212.621-2.362-0.795-1.751