We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZSCAN31
(GeneCards)
ModelZSC31_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusvbhRKSvGMWGGGChvKdRKRvh
Best auROC (human)0.914
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words270
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF24-like factors {2.3.3.10}
HGNCHGNC:14097
EntrezGeneGeneID:64288
(SSTAR profile)
UniProt IDZSC31_HUMAN
UniProt ACQ96LW9
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 4.64921
0.0005 6.787310000000001
0.0001 11.30236
GTEx tissue expression atlas ZSCAN31 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZSCAN31 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
016.05.042.035.08.014.015.03.015.020.046.04.03.010.013.05.0
027.03.016.06.010.021.01.017.058.031.06.021.02.035.03.07.0
0328.01.045.03.045.03.028.014.07.02.08.09.04.02.042.03.0
044.00.025.055.02.00.03.03.07.011.060.045.01.01.022.05.0
053.09.02.00.03.08.00.01.016.079.09.06.01.071.029.07.0
0613.07.02.01.0102.022.021.022.05.07.025.03.06.01.05.02.0
0718.01.0106.01.04.00.032.01.044.00.09.00.01.01.026.00.0
0858.08.01.00.00.01.00.01.02.0165.01.05.00.02.00.00.0
090.00.02.058.0120.04.035.017.01.00.00.01.00.00.06.00.0
101.00.0120.00.00.00.04.00.01.02.040.00.00.00.076.00.0
110.00.02.00.01.00.01.00.015.01.0214.010.00.00.00.00.0
121.00.015.00.01.00.00.00.076.00.0139.02.03.00.07.00.0
1342.037.02.00.00.00.00.00.04.0156.01.00.00.02.00.00.0
1410.03.00.033.0111.021.018.045.00.01.02.00.00.00.00.00.0
1529.015.066.011.05.02.013.05.011.03.04.02.01.027.044.06.0
161.00.08.037.06.06.027.08.07.010.054.056.01.03.010.010.0
171.04.07.03.06.07.04.02.067.011.019.02.010.05.09.087.0
1872.02.08.02.08.04.09.06.011.014.012.02.081.04.05.04.0
198.013.017.0134.01.05.011.07.02.012.016.04.00.02.07.05.0
200.00.010.01.010.07.013.02.08.011.026.06.043.06.095.06.0
217.033.015.06.07.08.04.05.019.031.088.06.01.05.06.03.0
227.04.011.012.016.039.07.015.072.016.014.011.02.01.07.010.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.899-1.0710.9990.818-0.625-0.084-0.016-1.54-0.0160.2661.089-1.278-1.54-0.41-0.156-1.071
02-0.753-1.540.047-0.899-0.410.314-2.4520.1061.3190.698-0.8990.314-1.8950.818-1.54-0.753
030.598-2.4521.067-1.541.067-1.540.598-0.084-0.753-1.895-0.625-0.512-1.278-1.8950.999-1.54
04-1.278-3.8150.4861.267-1.895-3.815-1.54-1.54-0.753-0.3181.3531.067-2.452-2.4520.36-1.071
05-1.54-0.512-1.895-3.815-1.54-0.625-3.815-2.4520.0471.627-0.512-0.899-2.4521.5210.632-0.753
06-0.156-0.753-1.895-2.4521.8810.360.3140.36-1.071-0.7530.486-1.54-0.899-2.452-1.071-1.895
070.162-2.4521.92-2.452-1.278-3.8150.73-2.4521.045-3.815-0.512-3.815-2.452-2.4520.524-3.815
081.319-0.625-2.452-3.815-3.815-2.452-3.815-2.452-1.8952.361-2.452-1.071-3.815-1.895-3.815-3.815
09-3.815-3.815-1.8951.3192.043-1.2780.8180.106-2.452-3.815-3.815-2.452-3.815-3.815-0.899-3.815
10-2.452-3.8152.043-3.815-3.815-3.815-1.278-3.815-2.452-1.8950.951-3.815-3.815-3.8151.588-3.815
11-3.815-3.815-1.895-3.815-2.452-3.815-2.452-3.815-0.016-2.4522.621-0.41-3.815-3.815-3.815-3.815
12-2.452-3.815-0.016-3.815-2.452-3.815-3.815-3.8151.588-3.8152.19-1.895-1.54-3.815-0.753-3.815
130.9990.873-1.895-3.815-3.815-3.815-3.815-3.815-1.2782.305-2.452-3.815-3.815-1.895-3.815-3.815
14-0.41-1.54-3.8150.761.9660.3140.1621.067-3.815-2.452-1.895-3.815-3.815-3.815-3.815-3.815
150.632-0.0161.448-0.318-1.071-1.895-0.156-1.071-0.318-1.54-1.278-1.895-2.4520.5621.045-0.899
16-2.452-3.815-0.6250.873-0.899-0.8990.562-0.625-0.753-0.411.2481.285-2.452-1.54-0.41-0.41
17-2.452-1.278-0.753-1.54-0.899-0.753-1.278-1.8951.463-0.3180.216-1.895-0.41-1.071-0.5121.723
181.535-1.895-0.625-1.895-0.625-1.278-0.512-0.899-0.318-0.084-0.234-1.8951.652-1.278-1.071-1.278
19-0.625-0.1560.1062.154-2.452-1.071-0.318-0.753-1.895-0.2340.047-1.278-3.815-1.895-0.753-1.071
20-3.815-3.815-0.41-2.452-0.41-0.753-0.156-1.895-0.625-0.3180.524-0.8991.022-0.8991.811-0.899
21-0.7530.76-0.016-0.899-0.753-0.625-1.278-1.0710.2160.6981.734-0.899-2.452-1.071-0.899-1.54
22-0.753-1.278-0.318-0.2340.0470.925-0.753-0.0161.5350.047-0.084-0.318-1.895-2.452-0.753-0.41