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Model info
Transcription factorZSCAN31
(GeneCards)
ModelZSC31_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusvbhRKSvGMWGGGChvKdRKRvh
Best auROC (human)0.914
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words270
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF24-like factors {2.3.3.10}
HGNCHGNC:14097
EntrezGeneGeneID:64288
(SSTAR profile)
UniProt IDZSC31_HUMAN
UniProt ACQ96LW9
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 4.64921
0.0005 6.787310000000001
0.0001 11.30236
GTEx tissue expression atlas ZSCAN31 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZSCAN31 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
016.05.042.035.08.014.015.03.015.020.046.04.03.010.013.05.0
027.03.016.06.010.021.01.017.058.031.06.021.02.035.03.07.0
0328.01.045.03.045.03.028.014.07.02.08.09.04.02.042.03.0
044.00.025.055.02.00.03.03.07.011.060.045.01.01.022.05.0
053.09.02.00.03.08.00.01.016.079.09.06.01.071.029.07.0
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110.00.02.00.01.00.01.00.015.01.0214.010.00.00.00.00.0
121.00.015.00.01.00.00.00.076.00.0139.02.03.00.07.00.0
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1529.015.066.011.05.02.013.05.011.03.04.02.01.027.044.06.0
161.00.08.037.06.06.027.08.07.010.054.056.01.03.010.010.0
171.04.07.03.06.07.04.02.067.011.019.02.010.05.09.087.0
1872.02.08.02.08.04.09.06.011.014.012.02.081.04.05.04.0
198.013.017.0134.01.05.011.07.02.012.016.04.00.02.07.05.0
200.00.010.01.010.07.013.02.08.011.026.06.043.06.095.06.0
217.033.015.06.07.08.04.05.019.031.088.06.01.05.06.03.0
227.04.011.012.016.039.07.015.072.016.014.011.02.01.07.010.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.899-1.0710.9990.818-0.625-0.084-0.016-1.54-0.0160.2661.089-1.278-1.54-0.41-0.156-1.071
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04-1.278-3.8150.4861.267-1.895-3.815-1.54-1.54-0.753-0.3181.3531.067-2.452-2.4520.36-1.071
05-1.54-0.512-1.895-3.815-1.54-0.625-3.815-2.4520.0471.627-0.512-0.899-2.4521.5210.632-0.753
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09-3.815-3.815-1.8951.3192.043-1.2780.8180.106-2.452-3.815-3.815-2.452-3.815-3.815-0.899-3.815
10-2.452-3.8152.043-3.815-3.815-3.815-1.278-3.815-2.452-1.8950.951-3.815-3.815-3.8151.588-3.815
11-3.815-3.815-1.895-3.815-2.452-3.815-2.452-3.815-0.016-2.4522.621-0.41-3.815-3.815-3.815-3.815
12-2.452-3.815-0.016-3.815-2.452-3.815-3.815-3.8151.588-3.8152.19-1.895-1.54-3.815-0.753-3.815
130.9990.873-1.895-3.815-3.815-3.815-3.815-3.815-1.2782.305-2.452-3.815-3.815-1.895-3.815-3.815
14-0.41-1.54-3.8150.761.9660.3140.1621.067-3.815-2.452-1.895-3.815-3.815-3.815-3.815-3.815
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22-0.753-1.278-0.318-0.2340.0470.925-0.753-0.0161.5350.047-0.084-0.318-1.895-2.452-0.753-0.41